串标主要操作人主动认罪的，司法机关会结合具体案情依法处理，通常会从宽处罚，但具体处理方式需根据犯罪情节、认罪态度、退赃情况等因素综合判断。以下是详细分析：

1. 从宽处罚的法律依据
   根据《刑法》第六十七条，犯罪嫌疑人主动认罪且如实供述罪行的，属于“自首”，可从轻或减轻处罚；若在侦查阶段即认罪认罚，还可依据《刑事诉讼法》第十五条适用“认罪认罚从宽制度”，进一步获得量刑优惠。例如，串标行为若原本可能判处三年以下有期徒刑，主动认罪后可能降至缓刑或更轻刑罚。

2. 具体情节对量刑的影响

   • 犯罪情节轻重：若串标金额巨大、造成重大损失或存在多次串标等恶劣情节，即使认罪，仍可能面临较重刑罚，但认罪态度会作为减轻情节考虑。
     
   • 退赃与赔偿：若主动退还非法所得、赔偿被害人损失，司法机关可能进一步从宽处理，甚至适用缓刑或非监禁刑。
     
   • 立功表现：若认罪后协助司法机关抓捕其他同案犯或提供关键证据，可能依据《刑法》第六十八条立功条款减轻处罚。

3. 程序上的处理流程

   • 侦查阶段：公安机关会重点核实认罪的真实性、自愿性，并固定相关证据（如串标合同、资金往来记录等）。
     
   • 审查起诉阶段：检察院会结合认罪态度、社会危害性等提出量刑建议，若符合认罪认罚条件，会签署《认罪认罚具结书》。
     
   • 审判阶段：法院会综合全案证据及认罪情节，依法判决，通常会在检察院量刑建议范围内从宽处理。

4. 实务中的注意事项

   • 认罪的彻底性：需如实供述全部犯罪事实，若隐瞒关键情节或翻供，可能失去从宽机会。
     
   • 律师介入的必要性：建议尽早委托律师协助沟通认罪认罚事宜，确保权益最大化（如争取更轻量刑、适用缓刑等）。
     
   • 行政处罚与刑事处罚的衔接：串标行为可能同时触犯《招标投标法》，除刑事责任外，还可能面临行政处罚（如罚款、吊销资质等），需同步处理。

总结：串标主要操作人主动认罪是重要的从宽情节，但最终处理需结合犯罪情节、退赃情况、立功表现等综合判断。建议及时委托律师介入，通过专业辩护争取最优结果。如有具体案情，可进一步向我咨询。