针对您提出的“有公章但无社会信用代码是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

首先，我们需要明确社会信用代码（或统一社会信用代码）的重要性。根据国务院办公厅关于加快推进“五证合一、一照一码”登记制度改革的通知，自2016年10月1日起，我国正式实施了“五证合一、一照一码”的登记制度改革。这一改革的核心内容之一，就是为企业核发加载统一社会信用代码的营业执照。这个统一社会信用代码，相当于企业的“身份证号”，是企业在经济活动中的重要身份标识，具有唯一性和全国通用性。

接下来，我们分析公章与社会信用代码的关系。公章是企业合法经营的重要凭证，用于证明企业身份和签署各类文件。然而，仅有公章并不足以证明企业的合法性和身份，因为公章本身并不包含企业的核心信息，如社会信用代码。社会信用代码作为企业的唯一标识，是企业在经济活动中进行身份验证、信息查询、业务办理等的重要依据。

那么，有公章但无社会信用代码是否合法呢？从法律层面来看，企业必须依法进行登记注册，并取得加载统一社会信用代码的营业执照。这是企业合法经营的基本前提。如果企业仅有公章而没有社会信用代码，那么这家企业在法律上可能并未完成完整的登记注册程序，其合法性可能会受到质疑。特别是在进行一些需要身份验证和信用查询的经济活动时，如开具发票、签订合同、申请贷款等，没有社会信用代码的企业可能会面临诸多困难和限制。

此外，根据《国家税务总局关于增值税发票开具有关问题的公告》等相关规定，企业在索取和开具增值税普通发票时，必须填写纳税人识别号或统一社会信用代码。这也进一步说明了社会信用代码在企业经济活动中的重要性。

综上所述，有公章但无社会信用代码的企业在法律上可能并未完成完整的登记注册程序，其合法性可能会受到质疑。因此，我们建议企业在经营过程中务必确保取得加载统一社会信用代码的营业执照，并妥善保管和使用公章，以确保企业的合法经营和顺利发展。