关于“代持协议能否查的出来”的问题，这主要取决于代持协议的具体情况以及查询的目的和途径。
首先，代持协议本身是一种法律文件，它记录了代持双方的权利和义务。在正常情况下，如果代持协议是合法签订的，并且双方都保留了协议的原件或复印件，那么这份协议当然是可以被查出来的，无论是通过双方自愿出示，还是在法律纠纷中作为证据被法院要求出示。
然而，问题可能更侧重于在不知情或未经授权的情况下，能否通过某种途径“查”到代持协议的存在。这通常涉及到信息获取的合法性和隐私保护的问题。
合法途径：
- 在法律纠纷中，如果代持协议成为争议焦点，法院有权要求双方出示相关证据，包括代持协议。
- 在某些监管或审计场景下，如公司并购、上市审查等，相关监管机构或审计机构可能要求公司或个人提供代持协议以核实股权结构或资产状况。
非法途径：
- 未经授权擅自获取他人代持协议是违法的，可能涉及侵犯隐私、商业秘密或违反数据保护法规。
- 在实际操作中，很难通过非法途径获取到代持协议，因为这类协议通常会被妥善保管，且双方都有保护协议内容的动机。
实际案例：
- 从提供的案例中可以看出，代持协议在法律纠纷中是可以被查出来的，并且往往成为解决纠纷的关键证据。例如，在北京市第四中级人民法院的股权代持纠纷案中，代持协议（或缺乏明确的代持协议）直接影响了案件的判决结果。
- 在另一个案例中，南康区纪委监委在调查国有企业管理人员违纪违法问题时，也是通过深入调查和询问，最终识破了代持的“障眼法”，查出了实际的股权结构和利益关系。
综上所述，代持协议本身是可以被查出来的，但查询的合法性和途径至关重要。在正常情况下，应该通过合法途径获取和使用代持协议；在涉及法律纠纷或监管审查时，应遵守相关法律法规和程序要求。如果未经授权擅自获取或使用他人代持协议，可能会面临法律责任。