在支付经济补偿金时，加班工资通常不计入计算基数，但存在特殊情况。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况：加班工资不计入经济补偿金计算基数
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。此处的“工资”需依据实施条例进一步明确。
- 《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条明确指出，经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资、计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入，但并未将加班工资纳入其中。
解读：
- 经济补偿金的计算基数应为劳动者正常工作时间内的应得工资，不包括因提供额外劳动而获得的加班工资。这是因为经济补偿金旨在弥补劳动者因劳动合同变更或解除而可能遭受的经济损失，而非对劳动者过去所有劳动付出的全面补偿。
二、特殊情况：加班工资可能计入经济补偿金计算基数
用人单位恶意规避责任：
- 如果用人单位存在恶意将本应计入正常工作时间的收入计入加班工资，以规避经济补偿金支付责任的情况，那么该部分被错误归类为“加班工资”的收入仍应计入经济补偿金的计算基数。
用人单位克扣、拖欠加班费导致劳动合同解除：
- 如果用人单位因为克扣、拖欠劳动者加班费等原因而导致劳动合同解除，那么在计算经济补偿金时，也应将未足额支付的加班工资等纳入工资基数进行计算。
三、实例分析
假设劳动者在离职前12个月的月平均工资（不包含加班费）为6000元，加班费平均为每月2000元。若不存在上述特殊情况，则经济补偿金的计算基数应为6000元，而非8000元。但若用人单位存在恶意将部分正常工资计入加班费的情况，或者因克扣、拖欠加班费导致劳动合同解除，那么在计算经济补偿金时，就需要将这部分被恶意计入或未足额支付的加班费纳入考虑范围。
四、建议与注意事项
劳动者：
- 在面对用人单位可能存在的恶意行为时，劳动者应保留好相关证据，如工资单、考勤记录、劳动合同等，以证明用人单位的恶意行为，从而维护自己的合法权益。
用人单位：
- 用人单位应合法合规地支付劳动者工资及加班费，避免引发不必要的法律纠纷。同时，在计算经济补偿金时，应严格按照法律规定进行，确保计算基数的准确性。
综上所述，经济补偿金的计算基数是否包含加班费并非一成不变，而是需要根据具体情况来判断。如果您对此问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。