结论：国检期间住建部门要求停工，建设单位是否需要补偿给施工单位窝工费，这并非一个绝对的问题，而是需要根据具体情况，特别是合同中的相关条款以及停工的具体原因和责任归属来判断。
分析如下：
合同条款的约定：
- 首先，需要审查建设工程施工合同中是否有关于因政府行为（如国检）导致停工时，窝工费用的承担问题的明确约定。
- 如果合同中有明确约定，如“因政府行为导致的停工，窝工费用由建设单位承担”，则建设单位应按照合同约定支付窝工费。
- 如果合同中没有明确约定，则需要进一步分析停工的具体原因和责任归属。
停工的具体原因和责任归属：
- 如果停工是由于住建部门基于公共安全、环境保护等合法、合理的理由要求的，且该要求并非针对特定施工单位或建设单位，而是普遍适用的，那么这种停工可能被视为不可抗力或政府行为导致的停工。
- 在这种情况下，如果合同中没有相反约定，建设单位可能不需要承担窝工费用，因为窝工并非由建设单位的原因造成。然而，这并不意味着施工单位必须自行承担所有损失，施工单位可能可以根据合同中的其他条款（如索赔条款）或相关法律法规（如《中华人民共和国民法典》中关于不可抗力的规定）来寻求一定的补偿或调整工期。
- 如果停工是由于建设单位自身的原因（如未按时提交审批资料、违反环保规定等）导致的，或者建设单位在停工期间存在过错（如未及时通知施工单位、未采取合理措施减少损失等），那么建设单位可能需要承担窝工费用。
相关法律法规的适用：
- 在处理此类纠纷时，还需要考虑相关法律法规的适用。例如，《中华人民共和国民法典》中关于合同履行、不可抗力、违约责任等规定，以及《中华人民共和国建筑法》等专门针对建筑行业的法律法规。
- 这些法律法规可能为双方提供了解决纠纷的法律依据和原则。
建议：
- 对于施工单位而言，在签订合同时应尽可能明确约定因政府行为导致停工时窝工费用的承担问题，以减少后续纠纷的可能性。
- 在发生停工情况时，施工单位应及时与建设单位沟通，了解停工的具体原因和预计持续时间，并采取合理措施减少损失。
- 如果双方无法就窝工费用的承担问题达成一致意见，可以考虑通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决纠纷。
后续行动：
- 如果您是施工单位或建设单位，且面临此类纠纷，建议您仔细审查合同条款和相关法律法规，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供针对性的法律意见。