结论前置：柜台还房贷通常不会被逾期信用卡扣款，但需结合具体还款账户、银行扣款规则及合同约定综合判断。以下分情况详细说明：

1. 还款账户与信用卡账户独立时，不会扣款

若房贷还款账户与信用卡账户完全独立（例如房贷绑定A银行卡，信用卡为B银行发行），且两账户无关联扣款协议，则逾期信用卡不会从房贷还款账户扣款。
法律依据：根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第21条，银行需明确告知持卡人扣款范围，未经同意不得擅自划扣其他账户资金。若两账户无关联，银行无权扣款。

2. 还款账户与信用卡同属一家银行时，需分情况判断

• 情况一：未签订自动扣款协议
  若房贷还款账户与信用卡同属一家银行，但未签订“信用卡逾期自动扣划其他账户资金”的协议，则银行无权扣款。
  例外：若信用卡章程或合同中明确约定“逾期时银行有权从持卡人名下其他账户扣款”，且持卡人签字确认，则可能被扣款。但此类条款需以显著方式提示（如加粗、加黑），否则可能因“格式条款无效”被驳回。

• 情况二：签订了自动扣款协议
  若持卡人曾与银行签订协议，授权银行在信用卡逾期时从名下其他账户（包括房贷还款账户）扣款，则银行可能扣款。
  风险提示：此类协议需持卡人主动签署，且银行需明确告知扣款范围。若未签署或未告知，扣款行为可能违法。

3. 特殊情况：银行误扣或系统故障

若银行因系统故障、操作失误等原因误扣房贷还款账户资金，持卡人可要求银行立即返还，并可向银保监会投诉或通过诉讼主张权利。
法律依据：根据《民法典》第122条，因他人没有法律根据取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。

建议行动

1. 核对合同与协议：检查信用卡申请表、房贷合同中是否包含“逾期扣划其他账户资金”的条款，确认是否签署相关授权协议。
   
2. 联系银行确认：若担心扣款，可直接联系银行客服，明确询问“信用卡逾期是否会从房贷还款账户扣款”。
   
3. 保留证据：若发生误扣，立即保存扣款记录、合同文本等证据，以便维权。

如有其他疑问，欢迎直接向我咨询，我会结合具体细节为您提供更精准的建议。