结论：开发商办理商品房房产证收取每户100元的代理费是否合法，需视具体情况而定，主要取决于该费用是否属于合理服务费用且是否经过相关部门批准或约定。

分析说明：

1. 合理服务费用角度：

   • 如果开发商在办理房产证过程中确实提供了额外的服务，如代为整理资料、跑腿办理等，且这些服务超出了其作为开发商的基本义务范围，那么收取一定的代理费作为服务报酬，在合理范围内是可以的。但关键在于“合理”，即费用应与服务内容、市场行情等相匹配。
   • 法律依据：虽然直接的法律条文可能并未明确规定此类代理费的具体数额，但根据《中华人民共和国民法典》中关于合同自由和公平原则的规定，双方可以在平等、自愿的基础上协商确定服务费用。

2. 相关部门批准或约定角度：

   • 开发商收取代理费还需考虑是否经过了相关部门的批准或备案，以及是否在购房合同中与购房者有明确的约定。如果未经批准或未在合同中约定，开发商单方面收取代理费可能涉嫌违规。
   • 实际操作建议：购房者在购房时，应仔细阅读购房合同，了解其中关于办理房产证及可能产生的费用的条款。如果合同中未明确约定代理费，购房者有权拒绝支付。

3. 地区性规定差异：

   • 不同地区可能对于开发商办理房产证收取代理费有不同的规定或习惯做法。有些地区可能明确禁止或限制此类费用的收取，而有些地区则可能相对宽松。
   • 查询建议：购房者可以咨询当地房地产管理部门或消费者协会，了解当地的具体规定和做法。

特殊场景：

• 如果开发商以办理房产证为名，强制收取高额代理费，且未提供相应服务或服务内容与费用明显不符，购房者可以向相关部门投诉或寻求法律援助。

行动建议：

• 作为购房者，在面对开发商收取代理费时，应保持警惕，仔细审查合同条款，了解费用构成和合理性。
• 如果对费用有疑问或认为不合理，可以与开发商进行协商，或向相关部门咨询、投诉。
• 在必要时，可以寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。

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