针对您提出的“母亲名下三块宅基地分配给两个儿子协议怎么写才有效”的问题，以下是一些详细的建议和步骤，以确保协议的合法性和有效性：

一、明确宅基地的性质与权益

首先，需要明确的是，在我国，宅基地属于农村集体所有，农民仅拥有宅基地的使用权，而非所有权。因此，在分配宅基地时，实际上是在分配宅基地的使用权，而非所有权。

二、协商与达成一致

1. 家庭内部协商：

   • 召集所有相关家庭成员（包括母亲、两个儿子及其他可能涉及的亲属）进行协商。
   • 确保各方充分表达意见，并努力达成一致意见。

2. 明确分配方案：

   • 根据宅基地的具体情况（如面积、位置、房屋状况等）和家庭成员的实际需求，制定合理的分配方案。
   • 方案应明确每块宅基地的归属、使用权分配方式以及可能的经济补偿等。

三、撰写协议

在协商达成一致后，应撰写正式的分配协议。协议应包含以下内容：

1. 基本信息：

   • 母亲的姓名、身份证号等基本信息。
   • 两个儿子的姓名、身份证号等基本信息。

2. 宅基地描述：

   • 详细描述每块宅基地的位置、面积、四至范围等。

3. 分配方案：

   • 明确每块宅基地的归属及使用权的分配方式。
   • 如涉及经济补偿，应明确补偿的金额、支付方式及时间等。

4. 权利与义务：

   • 明确各方在宅基地使用、维护等方面的权利与义务。

5. 违约责任：

   • 约定如违反协议应承担的违约责任。

6. 争议解决：

   • 约定如因协议产生争议时的解决方式（如协商、调解、诉讼等）。

7. 其他约定：

   • 根据实际情况添加其他必要的约定条款。

四、签署与见证

1. 签署协议：

   • 母亲及两个儿子应在协议上亲笔签名，并注明签署日期。

2. 见证与公证：

   • 如条件允许，可邀请无利害关系的第三方作为见证人，并在协议上签名。
   • 为增强协议的法律效力，可考虑前往公证处进行公证。

五、遵守相关规定与程序

最后，需要确保整个分配过程及协议内容符合当地农村宅基地管理的相关规定和程序。如需经农村集体经济组织批准或备案的，应按要求办理相关手续。

综上所述，通过明确宅基地的性质与权益、协商与达成一致、撰写详细的分配协议、签署与见证以及遵守相关规定与程序等步骤，可以确保母亲名下三块宅基地分配给两个儿子的协议具有法律效力并得到有效执行。