结论：父亲是否合法持有全部赔偿金，需根据具体情况判断。若赔偿金中包含母亲个人遗产部分，儿子作为法定继承人，有权要求分割；若赔偿金为父亲个人所有或已明确归属父亲，则父亲持有全部赔偿金合法。

详细分析：

1. 赔偿金性质与归属：

   • 死亡赔偿金：通常视为对死者家属的经济补偿和精神抚慰，不属于死者遗产。其分配一般遵循与死者关系的亲疏远近、与死者共同生活的紧密程度及生活来源等因素，由死者家属协商分配，协商不成可诉至法院。若母亲车祸去世的赔偿金中包含死亡赔偿金，且未明确约定归属，则儿子作为直系亲属，有权参与分配。
   • 被扶养人生活费：若赔偿金中包含被扶养人生活费，且儿子为被扶养人之一，则儿子有权获得相应部分的生活费。
   • 遗产部分：若赔偿金中包含母亲个人财产（如个人储蓄、房产等）的转化形式，或明确为母亲遗产的赔偿（如某些特定情况下的精神损害抚慰金等，具体需根据案件事实和法律规定判断），则这部分赔偿金应作为母亲遗产处理。

2. 遗产分配原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》继承编的规定，遗产继承开始后，按照法定继承办理；有遗嘱的，按照遗嘱继承或者遗赠办理；有遗赠扶养协议的，按照协议办理。
   • 在法定继承中，配偶、子女、父母为第一顺序继承人，原则上应均等分配遗产。但存在特殊情况时，如继承人生活有特殊困难又缺乏劳动能力，或对被继承人尽了主要扶养义务等，可多分；有扶养能力和有扶养条件的继承人，不尽扶养义务的，应不分或者少分。

3. 具体情形分析：

   • 若赔偿金中包含遗产部分：儿子作为法定继承人，有权要求分割母亲遗产部分的赔偿金。若父亲拒绝分割，儿子可通过协商、调解或诉讼等方式维护自己的合法权益。
   • 若赔偿金为父亲个人所有或已明确归属父亲：如赔偿金全部为父亲因失去配偶而获得的精神损害抚慰金，或已通过协议、调解等方式明确归属父亲，则父亲持有全部赔偿金合法，儿子无权要求分割。

建议：

• 协商解决：建议儿子先与父亲进行友好协商，明确赔偿金的性质和归属，尝试达成一致意见。
• 调解或诉讼：若协商不成，可寻求第三方调解机构（如人民调解委员会）的帮助，或直接向法院提起诉讼，由法院根据案件事实和法律规定进行判决。

后续行动：

• 儿子在维护自己权益的同时，也应考虑家庭关系的和谐与稳定，尽量通过和平方式解决问题。
• 若决定通过法律途径解决，建议儿子收集相关证据（如赔偿协议、家庭关系证明等），并咨询专业律师（即我，曹勇律师，专注于交通事故、保险理赔领域）的意见，以便更好地维护自己的合法权益。