在刑事诉讼中，管辖权异议的提出时间主要分为审查起诉阶段和审判阶段，具体如下：
审查起诉阶段：
- 犯罪嫌疑人及其辩护人可以在案件移送审查起诉后，人民检察院提起公诉前，向办理案件的人民检察院提出管辖权异议。人民检察院有义务对异议进行审查，并在受理异议后的五日以内作出决定。这一阶段是管辖权异议提出的早期阶段，对于确保案件由有管辖权的机关处理具有重要意义。
审判阶段：
- 庭前准备阶段：被告人在收到起诉书副本后的特定时间内，即提交答辩状期间内（通常为收到起诉书副本之日起10日内），可以提出管辖权异议。如果案件召开了庭前会议，被告人及其辩护人也可以在庭前会议阶段提出管辖权异议，并应当说明理由。人民法院经审查认为异议成立的，将依法处理，包括退回人民检察院或移送有管辖权的人民法院。
- 庭审阶段：在庭审过程中，当事人及其辩护人、诉讼代理人仍然有权提出管辖权异议。如果异议成立，可能会影响案件的审理进程，导致案件被移送至有管辖权的法院审理。
特殊情形下的管辖权异议提出时间：
- 对于反诉案件的管辖权问题，如果被告人认为受诉法院同时违反级别管辖和地域管辖规定，应当在提起反诉的同时提出管辖权异议；如果只是违反地域管辖，则应当在反诉案件答辩期间内提出管辖权异议。
- 第二审刑事案件中，当事人一般不得以法院无管辖权为由提出管辖权异议，因为二审法院对一审法院的管辖具有上级监督关系。但如果二审法院发现一审法院确实无管辖权而审理了案件，应裁定撤销原裁判并将案件移送有管辖权的人民法院审理。
法律后果与建议：
- 若管辖权异议成立，案件将被移送至有管辖权的人民法院进行审理；若异议不成立，则会被裁定驳回。
- 当事人及其辩护人、诉讼代理人应密切关注案件进展，确保在法定期限内提出管辖权异议，以维护自身合法权益。
- 如有任何疑问或需要进一步了解相关法律规定，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律意见和帮助。
在刑事诉讼中，管辖权异议的提出是一个重要的法律程序环节，它关乎案件的公正审理和当事人的合法权益。因此，当事人及其辩护人、诉讼代理人应充分了解相关法律规定，并在法定期限内正确行使这一权利。