合并登记，在当前的商事登记制度改革背景下，主要指的是“三证合一”或更进一步的“一照一码”登记制度。这一制度的实施，旨在简化企业注册流程，提高政府服务效率，并推动大众创业、万众创新。
具体来说，合并登记的含义包括以下几个方面：
三证合一：在传统的企业注册流程中，企业需要分别向工商行政管理部门、质量技术监督部门和税务部门申请营业执照、组织机构代码证和税务登记证。而“三证合一”登记制度则将这三个申请流程合并为一个，企业只需一次申请，即可由工商行政管理部门核发一个包含工商营业执照、组织机构代码和税务登记信息的营业执照，即“一照三号”营业执照（但在后续改革中，这一模式被“一照一码”所取代）。
一照一码：作为“三证合一”的升级版，“一照一码”登记制度进一步简化了流程。它通过“一窗受理、互联互通、信息共享”的方式，由工商行政管理部门直接核发加载法人和其他组织统一社会信用代码的营业执照。这个统一代码是唯一的，且包含了企业的所有基本信息，从而实现了“一照走天下”的便利。
改革意义：合并登记制度的实施，不仅大大简化了企业注册流程，降低了企业成本，还提高了政府服务效率，加强了部门间的信息共享和协同监管。同时，它也有助于推动形成大众创业、万众创新的热潮，促进市场经济的繁荣发展。
实施范围：合并登记制度最初主要适用于企业，但后续改革中，其适用范围逐渐扩大到农民专业合作社、外国（地区）企业常驻代表机构等各类市场主体。
过渡与换发：在改革实施过程中，对于已经按照传统方式登记的企业，政府会设定一个过渡期，允许它们在一定时间内继续使用原有证照，并在办理变更登记或注销登记时换发新的“一照一码”营业执照。过渡期结束后，未换发的营业证照将不再有效。
概括起来，合并登记是商事登记制度改革的重要举措之一，它通过简化流程、提高效率、加强监管等方式，为市场主体提供了更加便捷、高效的服务环境。