将自行车放在后备箱不关车门的行为，通常属于违法行为，但在特定且紧急的情况下，并采取了必要安全措施的，可能会有例外。以下是对此问题的详细分析：
一、违法行为的情况
违反道路交通安全法规：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第六十二条第一款的规定，驾驶机动车不得在车门、车厢没有关好时行车。因此，如果自行车放在后备箱导致车门无法关闭，或者后备箱盖无法正常关闭，这种行为就违反了该法规。
安全隐患：
- 后备箱未盖好或车门未关好行驶时，自行车可能因颠簸、刹车或加速而甩出车外，成为路面障碍物，危及其他车辆和行人的安全。
- 后备箱盖或车门翘起可能遮挡驾驶员视线，增加事故风险。
法律责任：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条的规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。因此，这种行为可能面临警告或罚款的处罚。
- 若因此导致车牌被阻挡，还可能构成“故意遮挡车牌”的违章行为，面临更严厉的处罚，包括扣分。
二、可能存在例外的情况
- 紧急且确保安全的前提：
- 在紧急情况下，如果自行车需临时搭载，并且驾驶人采取了必要的固定措施（如用绳索牢固固定自行车），确保自行车在行驶过程中不会晃动、掉落，同时不会对车辆的操控性、制动性等安全性能产生明显影响。
- 驾驶人能够及时与交警沟通并说明紧急情况，部分交警可能会根据实际情况给予理解和提醒，而不进行处罚。但这并非普遍现象，依赖于具体执法情况和交警的判断。
三、建议措施
合理安排物品摆放：
- 在装载自行车前，应充分考虑后备箱空间，合理安排物品摆放，确保能够顺利关闭后备箱和车门。
使用合适的运输工具：
- 如自行车无法完全放入后备箱并盖好，建议使用车顶行李架或安装专门的自行车架来运输，但需确保不违反法定高度限制，且不遮挡车辆号牌。
严格遵守交通法规：
- 严格遵守道路交通安全法律法规，确保车辆行驶安全，既是对自己负责，也是对他人生命财产安全的尊重和保护。
综上所述，将自行车放在后备箱不关车门的行为通常属于违法行为，但在紧急且确保安全的前提下，并采取了必要措施的，可能会有例外情况。为避免违法和确保安全，建议驾驶人严格遵守相关规定，并采取合理的运输方式。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。