法院认定原告主体不适格按撤诉处理，这一做法本身并不直接等同于违反法律程序，但具体是否违法需结合案件具体情况及法院的处理方式来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 原告主体不适格的法律含义：

   • 原告主体不适格，指的是原告不具备提起诉讼的资格或条件，即原告与案件无直接利害关系，或者其诉讼权利受到法律限制等。在这种情况下，法院有权对原告的起诉进行审查，并作出相应处理。

2. 法院处理原告主体不适格的方式：

   • 裁定驳回起诉：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，如果法院认为原告主体不适格，通常会裁定驳回起诉。这是一种正式的司法程序，旨在明确告知原告其起诉不符合法律规定的条件，从而终结诉讼程序。
   • 按撤诉处理：在某些情况下，如果原告在法院通知其补正材料或说明情况后，仍未能在规定时间内提供充分证据证明其主体资格，或者原告主动申请撤诉，法院可能会按撤诉处理。这种处理方式虽然不是直接针对主体不适格的裁定，但在实践中可能因原告未能有效证明其主体资格而间接导致。

3. 按撤诉处理是否违反法律程序：

   • 不直接违法：如果法院在按撤诉处理前，已经给予了原告充分的补正机会或说明情况的时间，且原告未能有效证明其主体资格，或者原告主动申请撤诉，那么法院按撤诉处理并不直接违反法律程序。
   • 可能违法的情况：如果法院在未给予原告充分补正机会或说明情况的时间，或者未对原告的主体资格进行充分审查的情况下，就直接按撤诉处理，那么这种做法可能构成程序违法。因为这剥夺了原告依法行使诉讼权利的机会，违反了公正、公平、公开的司法原则。

4. 法律建议：

   • 对于原告而言，如果认为法院按撤诉处理不当，可以在收到处理决定后，依法提起上诉或申请再审，以维护自己的合法权益。
   • 对于法院而言，在处理原告主体不适格的案件时，应严格遵循法律程序，给予原告充分的补正机会或说明情况的时间，并对原告的主体资格进行充分审查，以确保司法公正和效率。

总结来说，法院认定原告主体不适格按撤诉处理，并不直接等同于违反法律程序。但法院在处理此类案件时，必须严格遵循法律程序，确保原告的诉讼权利得到充分保障。如果原告认为法院的处理决定不当，可以依法寻求救济。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。