核心结论：公司实际股本与注册资本不符且股东间出现诉讼时，需先明确不符原因及性质，再根据不同情况采取相应处理措施，包括协商、内部治理程序纠正、诉讼解决等。

具体分析如下：

1. 明确不符原因及性质
   • 原因调查：首先要深入调查实际股本与注册资本不符的具体原因。这可能涉及虚假出资，比如股东承诺出资但未实际缴纳；抽逃出资，即股东在公司成立后将出资暗中撤回；也可能是公司增资或减资程序未依法完成等情况。例如，股东A承诺出资100万元，但实际只缴纳了50万元，这就属于虚假出资导致实际股本与注册资本不符。
   • 性质判断：判断这种不符是故意为之还是因疏忽等非故意因素造成。故意不符往往涉及股东的恶意行为，可能损害公司和其他股东的利益；非故意不符则可能是由于财务处理错误、信息沟通不畅等原因导致。比如，公司财务人员疏忽，将股东的出资记录错误，导致账面显示的实际股本与注册资本不符，这种情况相对主观恶意较小。
2. 根据不同情况采取处理措施
   • 协商解决：如果不符情况不严重，且股东之间有良好的沟通基础，可以优先考虑通过协商的方式解决。股东们可以坐下来，共同分析不符的原因，协商确定如何调整实际股本或注册资本，使其一致。例如，对于虚假出资的股东，要求其在一定期限内补足出资；对于抽逃出资的股东，责令其返还抽逃的资金。协商解决的好处是可以节省时间和成本，维护股东之间的合作关系。
   • 依据公司内部治理程序纠正：公司可以按照公司章程和相关法律法规的规定，通过股东会或董事会等内部治理机构，对实际股本与注册资本不符的情况进行纠正。比如，召开股东会，形成决议要求相关股东履行出资义务，或者按照法定程序进行增资或减资。如果公司章程规定了相应的处罚措施，如对虚假出资的股东进行罚款等，也可以依据章程执行。
   • 诉讼解决
     • 股东代表诉讼：如果公司内部治理机制无法有效解决问题，且公司的利益受到损害，符合条件的股东可以提起股东代表诉讼。例如，当公司管理层或控股股东故意隐瞒实际股本与注册资本不符的情况，损害公司利益时，其他股东可以以自己的名义代表公司提起诉讼，要求相关责任人承担赔偿责任。
     • 股东直接诉讼：如果股东自身的直接利益受到侵害，股东可以直接提起诉讼。比如，因实际股本与注册资本不符，导致股东的股权比例计算错误，影响了股东的分红权、表决权等权益，股东可以起诉要求纠正股权比例，并赔偿相应的损失。
3. 处理过程中的注意事项
   • 证据收集：在整个处理过程中，要注重收集和保存相关证据。这些证据包括公司的财务报表、出资凭证、股东会决议、沟通记录等。证据的充分性和有效性将直接影响诉讼的结果和协商的成效。例如，在证明股东虚假出资时，需要提供银行转账记录、验资报告等证据。
   • 遵守法律程序：无论是协商、内部治理程序还是诉讼，都要严格遵守相关的法律程序。比如，在进行增资或减资时，要按照公司法的规定，召开股东会、编制资产负债表及财产清单、通知债权人等；在提起诉讼时，要符合起诉的条件，按照法定程序提交诉状和证据。

如果公司实际股本与注册资本不符且股东之间出现诉讼，股东们应积极应对，通过合理合法的方式解决问题。如果你还有其他关于公司法律方面的问题，可以直接向我咨询。