指定案件中违法款和违纪款的收缴，需根据款项性质、主体身份及法律规定，分情况处理，具体如下：
- 违法款的收缴
违法款通常指违反法律、行政法规或国家规定，应当予以没收的财物或非法所得。收缴程序需严格依据《刑法》《行政处罚法》《刑事诉讼法》及相关司法解释：
- 刑事案件中的违法款：若案件涉及犯罪（如贪污、受贿、走私等），违法所得需通过刑事诉讼程序追缴。公安机关、检察院在侦查阶段可依法查封、扣押、冻结涉案财物；法院判决后，违法所得由法院执行部门上缴国库。例如，贪污案件中，被告人非法占有的公共财物需全额追缴。
- 行政案件中的违法款：若行为仅违反行政法规（如逃税、非法经营等），行政机关（如税务、市场监管部门）可依据《行政处罚法》作出没收违法所得、罚款等决定，并强制执行。例如，企业偷逃税款，税务机关可责令补缴税款并加收滞纳金，逾期不缴可申请法院强制执行。
- 特殊主体违法款：若违法主体为国家机关或公职人员，违法款可能涉及“小金库”、违规发放津贴等，需结合《监察法》处理。监察机关可对涉案财物采取查封、扣押措施，违法所得上缴国库。
- 违纪款的收缴
违纪款通常指违反党纪、政纪或单位内部规定，应当退还或没收的财物。收缴程序需依据《中国共产党纪律处分条例》《公职人员政务处分法》及单位规章制度：
- 党员干部违纪款：若涉及违反党纪（如违规收受礼品、违规从事营利活动等），纪检监察机关可责令退赔违纪所得，或直接收缴。例如，党员干部违规接受管理服务对象宴请，需退还餐费；违规兼职取酬的，需上缴违规所得。
- 公职人员违纪款：若涉及违反政纪（如滥用职权、玩忽职守等），监察机关可依据《公职人员政务处分法》作出没收违法所得、罚款等决定。例如，公职人员利用职务便利为亲友谋利并收受财物，需退赔并上缴国库。
- 单位内部违纪款：若行为仅违反单位规章制度（如虚报差旅费、违规使用公款等），单位可依据内部规定要求员工退还违规所得，或通过扣发工资、奖金等方式追缴。例如，员工虚报加班费，单位可要求其退还多领部分。
注意事项：
- 程序合法性：收缴违法款需严格遵循法定程序，如出具法律文书（如《没收决定书》《执行裁定书》）、告知当事人权利义务等，避免程序违法导致收缴无效。
- 证据充分性：收缴需以充分证据为基础，如银行流水、合同、证人证言等，证明款项的违法性或违纪性。
- 执行力度：若当事人拒不配合，可申请法院强制执行（如冻结银行账户、查封财产等），确保收缴到位。
若案件涉及复杂情节（如跨地区、涉外、金额巨大等），或对收缴程序有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情提供详细方案。