员工在申请仲裁补发工资时，需要准备一系列凭证来支持自己的主张，这些凭证主要包括以下几类：
劳动关系证明：
- 劳动合同：这是最直接的证明员工与公司存在劳动关系的文件。
- 工作证、工作服、考勤记录等：这些也可以作为辅助证据，证明员工在公司工作的事实。
- 社保缴纳记录：社保缴纳记录也是证明劳动关系的重要证据，因为它显示了公司为员工缴纳了社会保险。
工资发放记录：
- 工资条：工资条是证明员工工资数额和发放情况的最直接证据。
- 银行转账记录：如果工资是通过银行转账发放的，那么银行转账记录也是重要的证据，可以显示工资的发放时间、金额和收款人。
- 现金发放记录（如有）：如果工资是现金发放的，员工需要提供其他证据来证明，如签字确认的工资发放表等。
公司拖欠工资的证据：
- 公司书面通知或公告：如果公司曾发布过关于拖欠工资的书面通知或公告，员工应保留这些文件作为证据。
- 聊天记录、邮件等：如果员工与公司之间关于工资问题的沟通是通过聊天记录、邮件等方式进行的，这些也可以作为证据。
- 同事证言：如果有其他同事也遭遇了类似情况，他们的证言也可以作为辅助证据。
在准备这些凭证时，员工需要注意以下几点：
- 确保凭证的真实性：所有提供的凭证都必须是真实有效的，不能伪造或篡改。
- 凭证的完整性：尽量提供完整的凭证，如工资条应包含所有应发和实发项目，银行转账记录应显示完整的交易信息。
- 凭证的关联性：提供的凭证应与仲裁请求直接相关，能够证明公司拖欠工资的事实和数额。
如果员工在准备凭证过程中遇到困难或不确定如何操作，可以采取以下措施：
- 咨询专业律师：作为专业律师，我可以根据员工的具体情况，提供针对性的法律建议和指导，帮助员工准备充分的证据来支持自己的仲裁请求。
- 收集更多证据：如果现有证据不足，员工可以尝试通过其他途径收集更多证据，如与公司协商要求提供工资发放记录、向劳动监察部门投诉等。
最后，需要强调的是，仲裁补发工资是一个法律程序，员工需要遵循一定的法律程序和规定来维护自己的权益。因此，在准备凭证和进行仲裁过程中，员工应尽可能保持冷静和理性，遵循法律程序和规定来行事。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。