双方建房协议合同书并不一定要去公证，其法律效力不依赖于公证程序。是否选择公证，应根据双方的实际情况和需求来决定。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、建房协议合同书的法律效力
建房协议合同书，作为一种民事合同，只要满足以下条件，即具有法律效力：
- 真实意思表示：协议必须是双方或多方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。这意味着双方在签订协议时，必须是在自愿、平等的基础上，对协议内容有充分的理解和认同。
- 内容合法：协议内容不得违反法律法规的强制性规定，不得损害国家、集体和他人的合法权益。例如，协议中不能约定违反建筑规范、土地管理法规等条款。
- 完全民事行为能力：签订协议的双方在签订时均应具备完全民事行为能力。这通常要求双方为成年人，且精神健康，能够对自己的行为负责。
满足上述条件的建房协议合同书，自成立时起即具有法律效力，双方应当按照协议约定履行各自的义务。即使未经公证，该协议在涉及建房权益纠纷时，依然可以作为确定双方权利义务的重要依据。
二、公证带来的优势
虽然建房协议合同书不公证也有效，但公证确实能带来一些额外的优势：
- 增强证据效力：经过公证的建房协议合同书，在证据效力上比一般的协议书更高。如果日后因建房协议发生争议而诉至法院，公证文书可以直接作为认定事实的根据，除非有相反证据足以推翻该项公证。这大大减轻了主张协议内容一方的举证责任。
- 提高公信力：公证机构作为具有公信力的第三方，对协议的签订过程和内容进行审查和见证，使得协议更具公信力。这不仅可以预防纠纷的发生，还能在涉及建房交易、赠与等重大经济行为时，为双方提供更强的法律保障。
三、是否需要公证的决定因素
当事人在决定是否对建房协议合同书进行公证时，应考虑以下因素：
- 双方意愿：如果双方对协议内容非常确定，且信任对方的履约能力，那么不公证也是可以的。例如，双方是长期合作的伙伴，对彼此的信誉和履约能力有充分了解。
- 实际需求：如果希望增强协议的法律效力，或者对协议内容存在疑虑，担心未来可能发生争议，那么选择公证可能是一个更好的选择。例如，协议涉及金额较大、建房过程复杂或涉及多方利益时，公证可以提供更强的法律保障。
- 成本考量：公证需要支付一定的费用，因此双方在决定是否公证时，也应考虑成本因素。公证费用通常根据协议金额和公证机构的收费标准来确定，双方可以根据实际情况进行权衡。
四、法律建议
- 如果双方对协议内容非常确定且信任对方：可以选择不公证，但应确保协议内容真实、合法、有效，并妥善保存协议原件以备不时之需。
- 如果希望增强协议的法律效力或对协议内容存在疑虑：建议选择公证。公证可以提供更强的法律保障，降低未来发生争议的风险。
- 在签订协议前：双方应充分了解协议内容，明确各自的权利和义务，并咨询专业律师的意见以确保协议的合法性和有效性。
综上所述，双方建房协议合同书并不一定要去公证，其法律效力不依赖于公证程序。当事人可以根据自身的实际需求和情况来决定是否进行公证。无论选择何种方式，都应确保协议内容的真实、合法和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。