关于甲方拖欠乙方费用时滞纳金的计算问题，这主要取决于双方租赁合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同有约定的情况：

   • 滞纳金计算方式：如果租赁合同中明确约定了滞纳金的计算方式，比如按日加收一定比例的滞纳金，或者按月加收固定金额的滞纳金，那么应当按照合同中的约定来计算。例如，合同中可能规定“甲方若逾期支付租金，每逾期一日，需按未支付金额的0.05%向乙方支付滞纳金”。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。因此，合同中的滞纳金约定，在合法范围内，是受到法律保护的。

2. 合同无约定或约定不明的情况：

   • 滞纳金计算方式：如果租赁合同中没有约定滞纳金，或者约定不明确，那么乙方可能无法直接要求甲方支付滞纳金。但乙方可以依据《中华人民共和国民法典》中关于违约责任的规定，要求甲方承担因逾期支付费用而造成的实际损失，如利息损失等。
   • 实际损失的计算：在实际操作中，如果乙方要主张因甲方逾期支付费用而造成的利息损失，通常可以按照中国人民银行同期同类贷款利率或者全国银行间同业拆借中心公布的贷款市场报价利率来计算。例如，如果甲方逾期支付了10000元，逾期时间为30天，那么乙方可以要求的利息损失大致为：\(10000元 \times (贷款市场报价利率/365天) \times 30天\)。

3. 滞纳金的上限问题：

   • 法律规定：虽然合同可以约定滞纳金，但滞纳金的数额并非没有限制。如果约定的滞纳金过高，可能被法院认定为“过分高于造成的损失”，从而根据当事人的请求予以适当减少。一般来说，如果滞纳金超过了实际损失的30%，可能会被视为过高。
   • 调整机制：在诉讼或仲裁过程中，如果一方认为对方要求的滞纳金过高，可以向法院或仲裁机构提出调整请求。法院或仲裁机构会根据实际情况，综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等因素，对滞纳金进行适当调整。

建议：

• 在签订租赁合同时，双方应当明确约定滞纳金的计算方式和上限，以避免后续纠纷。
• 如果甲方已经拖欠费用，乙方应当及时与甲方沟通协商，要求甲方尽快支付费用及滞纳金（如果合同中有约定）。
• 如果协商无果，乙方可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益，比如向法院提起诉讼或申请仲裁。

总结来说，甲方拖欠乙方费用时滞纳金的计算，主要取决于合同中的约定以及相关法律法规的规定。在合同有约定的情况下，按照约定计算；在合同无约定或约定不明的情况下，可以依据实际损失来计算，并注意滞纳金的上限问题。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。