机动车检测站替车检测的处罚需根据具体行为性质及后果分情况讨论，主要涉及行政处罚与刑事责任两个层面，具体分析如下：
行政处罚层面
根据《道路交通安全法实施条例》第十五条及《检验检测机构监督管理办法》第二十六条，机动车检测站若存在“替车检测”（即用其他车辆替代待检车辆完成检测）行为，属于“出具虚假检验检测报告”的违法行为。监管部门可对其处以3万元以下罚款，并责令整改；情节严重的（如多次违规、造成重大安全隐患），可撤销其检验资质。
若检测站与车主或第三方串通实施替检，还可能因违反《治安管理处罚法》第五十二条“伪造、变造公文、证件、证明文件”的规定，对直接责任人处10日以上15日以下拘留，可并处1000元以下罚款；情节较轻的，处5日以上10日以下拘留，可并处500元以下罚款。
刑事责任层面
若替检行为导致存在安全隐患的机动车通过检测并上路，引发重大交通事故（如造成人员伤亡或重大财产损失），检测站及相关责任人可能因涉嫌《刑法》第一百三十四条重大责任事故罪或第一百三十七条工程重大安全事故罪被追究刑事责任。具体量刑需结合事故后果、责任比例等因素综合判定，最高可处七年以上有期徒刑。
此外，若检测站通过替检行为非法获利数额较大（如多次替检累计金额超过5万元），还可能构成《刑法》第二百六十六条诈骗罪，面临三年以下有期徒刑、拘役或管制的处罚；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑。
建议：检测站应严格遵守检测流程，杜绝替检行为；车主若发现检测站违规操作，可向当地市场监管部门或公安机关举报。若您涉及具体案件或需进一步分析，可直接向我咨询，我会结合细节提供针对性建议。