关于商铺租户违约时违约金的计算方式，这主要取决于租赁合同中的具体约定以及相关的法律法规。以下是对这一问题的详细解答：
一、合同有约定的情况
固定金额：
- 如果租赁合同中明确规定了违约金的具体金额，比如“若承租方违约，需支付X万元违约金”，那么违约方就应按此金额进行赔偿。
按一定比例或方式计算：
- 合同中也可能约定了违约金的计算方式，如“按照未履行租期租金总额的Y%计算违约金”。在这种情况下，需要根据实际未履行的租期租金总额来计算违约金的具体数额。
法律调整：
- 根据《民法典》的相关规定，如果约定的违约金过分高于或低于造成的实际损失，人民法院或仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少或增加。这体现了法律的公平原则，确保违约金的数额与违约行为造成的损失相当。
二、合同没有约定或约定不合理的情况
实际损失赔偿：
- 如果租赁合同中没有对违约金作出约定，或者约定的违约金数额明显不合理（如过高或过低），那么违约方应赔偿因其违约行为给对方造成的实际损失。这包括因违约导致的直接经济损失和合理的间接损失。
证据支持：
- 在这种情况下，受损方需要提供充分的证据来支持其实际损失的计算和主张，如租金收据、经营记录、损失清单等。
三、争议解决途径
协商调解：
- 首先，双方可以尝试通过友好协商或第三方调解来解决违约金赔偿的争议。
法律诉讼：
- 如果协商不成，受损方可以向人民法院提起诉讼，由法院根据法律规定和事实情况作出判决。
仲裁裁决：
- 如果租赁合同中包含了仲裁条款，当事人可以向约定的仲裁机构申请仲裁，由仲裁机构作出裁决。仲裁裁决具有法律效力，双方必须履行。
综上所述，商铺租户违约时违约金的计算方式应严格遵循合同约定和相关法律法规。在签订租赁合同时，建议双方仔细审查相关条款，确保违约金的约定合理、明确且符合法律法规的要求。同时，在合同履行过程中，应遵守诚信原则，避免恶意违约行为的发生。如发生纠纷，应及时寻求法律途径解决，以维护自身合法权益。