在开车等红绿灯时被醉驾追尾，一般情况下交警扣留您的车主要是为了调查事故原因和固定证据，而非直接认定您有责任，但这并不意味着您一定有责任或会被处罚。以下从几个角度为您详细分析：

1. 扣车目的与法律依据

根据《道路交通事故处理程序规定》等相关法律法规，交警在处理交通事故时，有权扣留事故车辆，目的是为了调查事故原因、收集证据。在您的情况下，由于对方是醉驾追尾，交警需要扣留车辆以检查刹车痕迹、车辆损坏情况等，从而确定事故责任。这一措施是针对事故本身，而非针对您个人。

2. 醉驾追尾的责任认定

在醉驾追尾的事故中，醉驾方通常会被认定为全责或主要责任。因为醉驾是严重的违法行为，且直接导致了事故的发生。然而，这并不意味着您完全无需承担任何责任。如果交警在调查过程中发现您的车辆存在安全隐患（如刹车失灵、灯光不全等），或者您在事故发生前有违规行为（如闯红灯、违规变道等），那么您也可能需要承担一定的责任。但这种情况在您描述的场景中较为少见。

3. 扣车期间的注意事项

• 配合调查：在车辆被扣留期间，您应积极配合交警的调查工作，提供必要的证件和资料。
• 了解扣车期限：根据相关规定，交警扣留车辆的时间一般不超过30日。如果因检验、鉴定需要延长扣留期限，交警会及时通知您。
• 关注事故认定书：在调查结束后，交警会出具事故认定书，明确事故责任。您应仔细阅读认定书内容，如有异议可及时提出复核申请。

4. 后续处理建议

• 保留证据：在事故发生后，您应尽可能保留现场照片、视频等证据，以便在后续处理中维护自己的权益。
• 咨询专业律师：如果您对事故责任认定或赔偿问题有疑问，可以及时向我咨询。我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。
• 关注赔偿事宜：如果事故造成您的人身伤害或财产损失，您可以根据事故认定书向对方主张赔偿。如果对方拒绝赔偿或赔偿金额不合理，您可以通过法律途径解决。

总结来说，开车等红绿灯时被醉驾追尾，交警扣留您的车主要是为了调查事故原因和固定证据。在责任认定上，醉驾方通常会被认定为全责或主要责任。但您也应积极配合调查工作，并关注后续处理事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。