结论：朋友借款1000元，三天后多还500元，这一行为是否合法或存在其他问题，需分情况讨论。

1. 若多还的500元为自愿赠与：

   • 法律背景：根据《民法典》的相关规定，民事主体有权处分自己的财产，包括赠与他人。若借款人明确表示多还的500元为赠与，且出借人接受，则这一行为构成赠与合同，合法有效。
   • 法律建议：在此情况下，双方无需进行额外的法律操作，赠与行为已经完成，具有法律效力。

2. 若多还的500元为误还或存在其他误解：

   • 法律背景：若借款人因误解或疏忽而多还了款项，这可能构成不当得利。根据《民法典》的规定，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。
   • 法律建议：
     • 借款人角度：若借款人发现多还了款项，应及时与出借人沟通，说明情况并请求返还。若出借人拒绝返还，借款人可以通过法律途径（如起诉）来维护自己的合法权益。
     • 出借人角度：若出借人收到多还的款项，且明知或应知该款项为误还，应主动返还给借款人。若拒绝返还，可能面临法律责任。

3. 若多还的500元涉及高利贷或非法利息：

   • 法律背景：根据《民法典》及《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，民间借贷的利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率的四倍。若多还的500元被视为利息，且该利息超过了法定上限，则超出部分不受法律保护。
   • 法律建议：
     • 借款人角度：若借款人认为多还的款项为非法利息，可以拒绝支付超出法定上限的部分，并可以通过法律途径来确认利息的合法性。
     • 出借人角度：出借人应确保收取的利息在法定范围内，否则可能面临法律制裁，如利息被没收、罚款等。

进一步思考：在实际操作中，双方应保留好相关的转账记录、聊天记录等证据，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。同时，对于涉及金钱往来的事项，建议双方在事前明确约定好相关条款，如借款金额、还款期限、利息等，以避免不必要的纠纷。若遇到复杂的法律问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。