运输生猪的车辆若未进行备案，将依据《中华人民共和国动物防疫法》及相关地方法规面临行政处罚，包括责令改正、罚款，甚至可能停业整顿。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据与备案要求

   • 根据《中华人民共和国动物防疫法》第五十二条第三款，从事动物运输的单位、个人及车辆必须向所在地县级人民政府农业农村主管部门备案，并妥善保存行程路线和托运人提供的动物名称、检疫证明编号、数量等信息。这是法律对生猪运输车辆备案的明确要求，旨在加强动物防疫管理，防止疫病传播。

2. 处罚依据与具体措施

   • 依据《中华人民共和国动物防疫法》第九十八条第三项，未经备案从事动物运输的，将由县级以上地方人民政府农业农村主管部门责令改正，并处三千元以上三万元以下罚款；情节严重的，可责令停业整顿，并处三万元以上十万元以下罚款。这一条款明确了未备案运输生猪车辆的法律责任和处罚措施。

3. 地方规定与处罚差异

   • 各地为加强生猪运输管理，可能出台更具体的地方法规。例如，某些地方规定对未备案车辆责令限期改正，逾期未改则处以固定额度罚款（如五千元）。因此，具体处罚措施和额度可能因地区而异，但均基于国家法律的框架内。

4. 实际案例与处罚情况

   • 在实际案例中，如李某某、吴某某、袁某某等因运输生猪车辆未备案而被处罚，罚款金额从三千元到五千元不等。这些案例体现了法律执行的实际操作，也警示了生猪运输车辆必须依法进行备案。

5. 处罚流程与影响因素

   • 主管部门发现未备案车辆后，首先会责令当事人改正违法行为。若未及时改正或情节严重，将依法处以罚款，甚至停业整顿。处罚结果受多种因素影响，如车辆是否造成动物疫病传播风险、是否积极配合整改等。

6. 建议与指导

   • 从事生猪运输的单位和个人应严格遵守法律，确保车辆已备案，并妥善保存运输过程中的相关信息。同时，应加强对动物防疫法律法规的学习，提高法律意识和防疫责任。一旦被发现未备案，应立即配合主管部门进行整改，以减轻可能的处罚。

综上所述，运输生猪的车辆必须依法进行备案，以避免面临行政处罚。若您在生猪运输过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。