酒驾醉驾的处罚中，摩托车驾驶证和汽车驾驶证不能分开处理，而是会合并处理。具体分析如下：

1. 驾驶证的统一性：在我国，驾驶证是按照准驾车型进行分类的，但驾驶人持有的驾驶证是一个整体证件，无论其准驾车型是摩托车还是汽车，都记录在同一个驾驶证上。因此，当驾驶人因酒驾或醉驾被处罚时，处罚措施是针对其整个驾驶资格，而非单独针对某一类准驾车型。

2. 处罚的合并性：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，酒驾和醉驾的处罚措施包括罚款、暂扣或吊销驾驶证、拘留等。这些处罚措施是针对驾驶人的整体驾驶行为，而非单独针对其驾驶摩托车或汽车的行为。因此，如果驾驶人同时持有摩托车驾驶证和汽车驾驶证，并因酒驾或醉驾被处罚，其处罚结果将同时影响其所有准驾车型的驾驶资格。

3. 具体处罚措施：

   • 酒驾：饮酒后驾驶机动车的，处暂扣六个月机动车驾驶证，并处一千元以上二千元以下罚款。因饮酒后驾驶机动车被处罚，再次饮酒后驾驶机动车的，处十日以下拘留，并处一千元以上二千元以下罚款，吊销机动车驾驶证。这里的“机动车”包括摩托车和汽车等所有机动车辆。
   • 醉驾：醉酒驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门约束至酒醒，吊销机动车驾驶证，依法追究刑事责任；五年内不得重新取得机动车驾驶证。如果醉酒驾驶营运机动车，处罚将更为严厉，包括吊销机动车驾驶证、依法追究刑事责任、十年内不得重新取得机动车驾驶证，重新取得机动车驾驶证后，不得驾驶营运机动车。

4. 特殊情况：虽然一般情况下摩托车驾驶证和汽车驾驶证不能分开处理，但如果驾驶人因酒驾或醉驾被吊销驾驶证后，其重新考取驾驶证时，可能需要根据具体情况重新申请所有准驾车型的驾驶证，或者根据当地交通管理部门的规定，先考取部分准驾车型的驾驶证。但这并不意味着原处罚是分开进行的，而是重新考取驾驶证时的程序要求。

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