面包车非法改装飞翼门将面临行政处罚，具体处罚措施需根据改装行为是否符合法规要求及是否造成安全隐患等情形综合判定，以下分情况说明：
若面包车改装飞翼门未依法办理变更登记手续
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条及《机动车登记规定》第十五条、第十六条，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。飞翼门改装涉及车身结构变更，若未在改装后十日内向车辆管理所申请变更登记，公安机关交通管理部门将责令恢复原状，并处以警告或200元以下罚款。
若改装行为导致车辆安全性能下降或存在重大隐患
根据《道路交通安全法》第一百条，驾驶拼装或已达到报废标准的机动车上道路行驶的，公安机关交通管理部门将予以收缴、强制报废，并对驾驶人处以200元以上2000元以下罚款，同时吊销机动车驾驶证。若改装飞翼门导致车辆结构强度不足、开门时占用公共空间影响安全等情形，可能被认定为“拼装”或“存在安全隐患”，从而面临上述处罚。
若改装行为符合法规要求且已办理合法手续
若改装飞翼门属于《机动车登记规定》第十六条允许的“小型、微型载客汽车加装前后防撞装置”等有限改装情形（需注意：飞翼门通常不属于此类），或已通过特殊审批（如特种车辆改装许可），且改装后车辆通过安全技术检验，则不构成违法。但此类情形极为特殊，需严格符合法规及审批要求。
建议：若需改装车辆，应提前向车辆管理所咨询具体要求，确保改装行为合法合规；若已改装，需尽快补办变更登记手续或恢复原状，避免因违法改装承担行政责任甚至刑事责任（如因改装导致重大交通事故，可能涉嫌交通肇事罪）。如有进一步疑问，可直接向我咨询。