法院是否认定小贷公司跨区域经营受法律保护，需视具体情况及当地监管政策而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、法律法规层面
一般原则：
- 小额贷款公司的经营通常受到严格的区域限制，这是为了维护金融秩序，防止跨区域经营可能带来的风险。根据相关规定，小额贷款公司原则上应在公司登记机关所在地的县级行政区域内开展业务。对于经营管理能力较强、评级良好的小额贷款公司，经地方金融监管部门批准，可以放宽经营区域限制，但一般也不得超出所在省级行政区域。
特殊情况：
- 如果小额贷款公司经过地方金融监管部门的批准，获得了跨区域经营的许可，那么其跨区域经营行为是合法的，受法律保护。这种情况下，法院会认定其经营行为的有效性。
二、监管政策层面
地方监管差异：
- 不同地区的金融监管政策可能存在差异。一些地区可能对小额贷款公司的跨区域经营持开放态度，只要符合相关条件并获得批准，就允许其跨区域经营。而另一些地区则可能严格限制小额贷款公司的跨区域经营，以维护本地金融市场的稳定。
政策变动：
- 金融监管政策可能随着时间和经济形势的变化而调整。因此，小额贷款公司在考虑跨区域经营时，需要密切关注当地金融监管政策的动态，确保自己的经营行为符合最新政策要求。
三、司法实践层面
法院裁判原则：
- 法院在裁判小额贷款公司跨区域经营案件时，会综合考虑法律法规、监管政策以及案件具体情况等因素。如果小额贷款公司的跨区域经营行为符合法律法规和监管政策的要求，且未损害他人合法权益，法院通常会认定其经营行为的有效性。
案例参考：
- 在实际司法实践中，存在小额贷款公司因未经批准跨区域经营而被法院认定无效的案例。这些案例通常涉及小额贷款公司未经地方金融监管部门批准，擅自跨区域发放贷款或开展其他业务活动，扰乱了金融秩序，损害了他人合法权益。
四、法律建议
合规经营：
- 小额贷款公司在考虑跨区域经营时，应首先确保自己的经营行为符合法律法规和监管政策的要求。这包括获得必要的批准和许可、遵守相关业务规范和风险控制要求等。
风险防控：
- 跨区域经营可能带来一系列风险，如信用风险、市场风险、操作风险等。小额贷款公司应建立完善的风险防控体系，加强对跨区域经营业务的风险评估和监控，确保业务稳健发展。
法律咨询：
- 在跨区域经营过程中，小额贷款公司如遇到法律问题或纠纷，应及时咨询专业律师，获取专业的法律意见和帮助。这有助于公司更好地维护自身合法权益，避免不必要的法律风险。
如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。