当存在多个申请执行人申请执行同一被执行人时，执行顺序的确定是一个涉及法律原则、具体情形以及实际操作多个层面的复杂问题。以下是对此问题的详细解答：
一、基本原则
优先受偿权原则：
- 某些债权，如抵押权、质权等担保物权，依法享有优先受偿权。这意味着，如果被执行人的财产已经设定了抵押或质押，那么抵押权人或质权人有权在抵押物或质押物的价值范围内优先获得清偿。
查封、扣押、冻结顺序原则：
- 在没有优先受偿权的情况下，法院通常会按照采取查封、扣押、冻结措施的顺序来分配被执行人的财产。先采取保全措施的债权人，在执行中可能会占据更有利的位置。但这并不意味着后申请执行的债权人就无法获得清偿，他们需要在先申请的债权人受偿后，等待剩余财产的分配。
按比例分配原则：
- 如果被执行人的财产不足以清偿全部债务，且各债权人均无优先受偿权，那么法院通常会按照各债权人的债权比例进行分配。这一原则确保了所有债权人在同等条件下能够公平地分享被执行人的财产。
二、特殊情形下的处理
参与分配制度：
- 当被执行人的财产不足以清偿多个债权时，其他已经取得生效法律文书但尚未申请执行的债权人可以申请参与分配。参与分配的债权人需要满足一定条件，如已取得生效法律文书、未超过申请执行时效期间等。在参与分配时，各债权人的受偿顺序和比例将依据法律规定和实际情况进行确定。
轮候查封与首封法院的协调：
- 如果多个法院对同一财产采取了查封措施，可能会出现轮候查封的情况。在这种情况下，首封法院在处置查封财产时，需要考虑轮候查封债权人的利益，确保财产处置的合法性和合理性。轮候查封法院也可以依法向首封法院申请参与分配或协商处置方案。
刑事追缴、退赔与民事债权的冲突解决：
- 当被执行人同时承担刑事责任和民事责任时，需要明确不同性质债权的清偿顺序。根据相关司法解释，退赔被害人损失应优先于其他民事债务，而罚金刑的执行则需要在民事债权清偿后进行。
三、申请执行人的权利与义务
权利：
- 申请执行人有权向法院申请执行生效法律文书确定的债权。
- 在执行过程中，双方可以自愿达成和解协议，变更履行内容。如果被执行人不履行和解协议，申请执行人可以申请恢复执行原生效法律文书。
- 申请执行人还有权了解案件执行情况，对法院的分配方式提出异议，并提起诉讼。
义务：
- 申请执行人应积极主动向法院提供被执行人的财产状况或线索，配合执行活动。
- 如果被指令保管被查封、扣押、冻结的财产，申请执行人不得使用、处分这些财产。
四、实际操作建议
- 及时申请财产保全：为了保障自身权益，债权人应及时向法院申请财产保全措施，防止被执行人转移或隐匿财产。
- 密切关注执行进展：债权人应主动了解案件执行情况，配合法院提供线索并参与分配程序。
- 依法主张权利：如果发现其他债权人存在恶意串通损害自身利益的行为，申请执行人可以通过异议程序或诉讼途径维护自己的合法权益。
综上所述，当存在多个申请执行人时，法院将严格按照法律规定和程序处理执行案件，确保债权分配的公平、公正与合法性。同时，申请执行人也应充分了解自己的权利和义务，积极配合法院的执行工作，以维护自身的合法权益。