核心结论：在对方全责的交通事故中，保险公司赔偿误工费时，一般不应减掉公司已发放的工资，但需结合具体情况判断。以下是详细分析：

1. 误工费的赔偿原则

根据《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第七条，误工费是指受害人因交通事故导致无法正常工作而减少的收入，赔偿标准为“受害人有固定收入的，误工费按照实际减少的收入计算”。
关键点：误工费赔偿的是“实际减少的收入”，而非“全部收入”。若公司已发放工资，理论上误工费应扣除已发放部分；但若公司未扣发工资（如带薪休假、病假工资等），则保险公司需全额赔偿。

2. 公司发放工资的常见情形及处理

• 情形一：公司正常发放工资（未扣减）
  若公司未因事故扣发工资（如带薪休假、病假工资），则受害人实际收入未减少，保险公司无需赔偿误工费。但若受害人因事故额外产生收入损失（如加班费、奖金等），可主张赔偿。

• 情形二：公司扣发部分工资
  若公司扣发了事故期间的工资（如事假、停薪留职），则保险公司需赔偿扣发部分。例如：月工资1万元，公司扣发5000元，则保险公司需赔偿5000元。

• 情形三：公司未发放工资（如无薪假）
  若公司未发放任何工资，则保险公司需全额赔偿误工费，标准为受害人事故前的平均收入（需提供工资流水、纳税证明等证据）。

3. 实务中的注意事项

• 证据要求：需提供公司出具的工资扣发证明、银行流水、劳动合同等材料，证明实际收入减少情况。
  
• 保险公司抗辩：保险公司可能以“公司已发放工资”为由拒赔，此时需结合公司实际扣发情况反驳。
  
• 特殊情况：若受害人为自由职业者或无固定收入，需按最近三年平均收入或当地同行业工资标准计算误工费。

4. 建议行动

1. 立即联系公司HR确认事故期间工资发放情况，并要求出具书面证明；
   
2. 收集工资流水、纳税证明、劳动合同等材料；
   
3. 若保险公司拒赔或扣减不合理，可向法院起诉主张权利。

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细解答。