民法典合同相对性原则和农民工工资的关系，主要体现在《保障农民工工资支付条例》对于农民工工资支付责任的特殊规定上，这些规定在一定程度上突破了合同相对性原则。

一、合同相对性原则

合同相对性原则是民法典中的一项基本原则，它指的是合同关系只能发生在特定的主体之间，只有合同当事人一方能够向合同的另一方当事人基于合同提出请求或提起诉讼。简言之，合同关系具有相对性，即主体相对、内容相对、责任相对。

二、农民工工资支付的特殊规定

然而，在农民工工资支付的问题上，《保障农民工工资支付条例》作出了一些特殊规定，这些规定在特定情况下突破了合同相对性原则。具体来说：

1. 建设单位责任：

   • 若建设单位未按时拨付工程款，导致农民工工资拖欠，建设单位需以未结清的工程款为限先行垫付被拖欠的农民工工资。这一规定使得建设单位在特定情况下成为了农民工工资支付的责任主体，尽管其与农民工之间可能并不存在直接的合同关系。

2. 分包单位责任：

   • 分包单位对所招用农民工的实名制管理和工资支付负直接责任。即使分包合同合法有效，施工总承包单位仍要对分包单位欠付的农民工工资先行清偿，再依法进行追偿。这一规定强化了分包单位在农民工工资支付上的责任，并突破了合同相对性，使得施工总承包单位在特定情况下也需承担支付责任。

3. 违法发包或分包的责任：

   • 若建设单位或施工总承包单位将建设工程发包或分包给个人或不具备合法经营资格的单位，导致拖欠农民工工资的，由建设单位或施工总承包单位清偿。这一规定进一步突破了合同相对性，使得违法发包或分包的责任主体在农民工工资支付上承担连带责任。

三、总结

综上所述，民法典合同相对性原则在农民工工资支付的问题上受到了一定程度的突破。这主要体现在《保障农民工工资支付条例》对于建设单位、分包单位以及违法发包或分包的责任主体在农民工工资支付上的特殊规定上。这些规定旨在保护农民工的合法权益，确保他们能够按时足额获得工资，并防止因合同相对性原则而导致的支付责任逃避现象。