当抵押车被法院扣押后，作为相关权益方（尤其是抵押权人），您可以按照以下清晰、详细的步骤来处理，以有效维护自身权益：
一、迅速了解扣押原因与核实抵押详情
联系法院：第一时间与实施扣押的法院取得联系，询问车辆被扣押的具体法律缘由。这通常与债务纠纷、民事赔偿案件等相关，了解原因有助于您后续采取针对性措施。
核实抵押情况：向抵押人（即车辆的原所有者或借款人）询问是否存在未告知的法律纠纷，并仔细检查抵押合同。确保抵押合同合法、完备，并已办理抵押登记。根据《民法典》规定，交通运输工具的抵押权自抵押合同生效时设立，但未经登记不得对抗善意第三人。因此，已登记的抵押权在法律上更具保障。
明确抵押顺位：若车辆上存在多个抵押权，您需要明确自身的抵押顺位。这将直接影响您在后续车辆处置中的受偿顺序。
二、向法院正式主张权利并参与分配
提交证明材料：在确认抵押权后，向法院提交相关证明材料，如抵押合同、登记证明等，以正式表明您对车辆的合法抵押权。
申请参与分配：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》，享有优先权或担保物权的债权人可直接申请参与分配。因此，您应及时向法院提出参与分配的申请，要求在车辆处置所得中优先受偿您的债权。
关注处置程序：密切关注车辆评估、拍卖或变卖的程序进展。确保评估价值合理，且拍卖公告依法发布，以保障您的权益不受损害。
三、监督款项分配与尝试协商解决
监督款项分配：车辆处置后，您需要监督法院按照法律规定和债权顺位进行款项分配。确保您的债权得到优先清偿，这是维护您权益的重要环节。
继续追偿：若处置款项不足以清偿您的全部债权，您仍有权向抵押人继续追偿。这是法律赋予您的权利，应积极行使。
协商解决方案：在可能的情况下，您可以考虑与抵押人、申请执行人等相关方协商解决方案。例如，提供其他担保物、偿还部分债务等，以解除车辆扣押状态。协商是一种更为灵活、高效的解决方式，有助于减少各方损失。
提起诉讼：若协商不成，您可以依法向法院提起诉讼，请求确认抵押权并保障优先受偿权。在诉讼过程中，您需要提供充分证据支持自己的主张，以维护自身合法权益。
综上所述，面对抵押车被法院扣押的情况，您应保持冷静并积极采取行动。通过明确扣押原因、核实抵押情况、向法院主张权利、参与分配程序、监督款项分配以及尝试协商解决或提起诉讼等途径，您可以有效维护自身的合法权益。在整个过程中，与法院、抵押人的良好沟通以及法律知识的充分运用是关键所在。