农村宅基地使用者自行交换宅基地，未经法定程序，是不合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律基础与限制
宅基地的集体所有性质：宅基地属于农民集体所有，农村村民仅享有使用权。根据《中华人民共和国土地管理法》及《民法典》的相关规定，宅基地使用权的取得、行使和转让均须遵循土地管理法律和国家有关规定。这意味着，宅基地的使用权并非村民个人可以随意处置的财产，而是受到法律严格限制的。
严格审批程序：宅基地使用权的交换必须履行严格的法律程序。双方需为本集体经济组织成员，向集体经济组织提出申请，经同意后报乡（镇）人民政府审核，最终由县级人民政府批准。未经此程序，私自交换无效。这一规定确保了宅基地交换的合法性和规范性，防止了宅基地的非法流转和滥用。
变更登记要求：根据《中华人民共和国土地管理法》第十二条的规定，依法改变土地权属的，应办理变更登记手续。未办理变更登记的，不仅权利变动不具有法律效力，还可能面临县级以上人民政府土地行政主管部门的责令限期办理。因此，宅基地交换后，双方必须前往相关部门办理宅基地使用权变更登记手续，以确保双方权益得到法律保障。
二、私自交换宅基地使用权的后果
法律后果严重：私自交换宅基地使用权，未办理变更登记手续的，双方权利不受法律保护。一旦产生纠纷，如一方反悔或涉及第三方权益时，将无法有效维护自身权益。此外，还可能面临法律处罚，如被责令限期办理变更登记、罚款等。
管理秩序受影响：私自交易可能导致土地权属混乱，破坏农村土地管理秩序。这会影响土地资源的合理分配和有效利用，甚至可能引发社会矛盾和不稳定因素。
可能面临处罚：根据法律规定，不办理土地变更登记的，县级以上人民政府土地行政主管部门有权责令其限期办理，并可能面临相应的法律处罚。这进一步强调了办理变更登记手续的重要性。
三、宅基地使用权交换的正确流程
资格确认：双方必须属于同一集体经济组织，且都合法拥有宅基地的使用权。这是宅基地交换的前提条件，确保了交换的合法性和规范性。
签订合同：双方应签订书面的宅基地互换合同，详细约定互换的具体内容、条件及双方的权利和义务。合同内容应真实、合法、有效，不得违反法律法规和政策规定。
备案与审批：双方应向发包方进行备案，并按照法定程序向集体经济组织、乡（镇）人民政府及县级人民政府提交申请，经审核批准后方可进行交换。这一步骤确保了宅基地交换的合法性和规范性，防止了非法流转和滥用。
办理变更登记：最后，双方应前往相关部门办理宅基地使用权变更登记手续，确保双方权益得到法律保障。这是宅基地交换的最后一步，也是至关重要的一步。
四、特殊情况下的合法性探讨
虽然一般情况下农户不得私自交换宅基地使用权，但在特定条件下，如因继承导致的宅基地流转或同村村民之间的转让（经过村委会同意和相关部门的批准后），宅基地的使用权可以在本集体经济组织成员之间进行流转。但这种流转必须遵循相关法律法规和政策规定，并办理相应的审批手续。
总结：农村宅基地使用者自行交换宅基地，未经法定程序，是不合法的。为了确保交换行为的合法性和有效性，交换双方必须严格遵守相关法律法规和政策规定，并履行必要的程序和手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。