无证驾驶巡游出租车肇事，运管部门会从无证驾驶和非法营运两方面进行处罚，具体如下：
无证驾驶的处罚：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十九条，未取得机动车驾驶证、机动车驾驶证被吊销或者机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。
- 若肇事行为构成犯罪，如交通肇事罪，还将依法追究刑事责任。
非法营运的处罚：
- 依据《巡游出租汽车经营服务管理规定》等相关法规，未取得巡游出租汽车经营许可，擅自从事巡游出租汽车经营活动的，由县级以上地方人民政府出租汽车行政主管部门责令改正，并处以罚款。罚款金额通常根据违法行为的严重程度和地区差异而定，一般较高，可能达到数千元甚至更高。
- 若非法营运行为情节严重，如多次违法、造成严重后果等，还可能面临更严厉的处罚，包括但不限于吊销相关证件、没收违法所得等。
综合分析：
- 无证驾驶巡游出租车肇事，不仅违反了道路交通安全法规，还违反了出租汽车经营服务管理规定，因此将同时面临交通管理部门和运管部门的双重处罚。
- 处罚的严重程度将取决于肇事行为的后果、违法行为的情节以及地区差异等因素。
建议：
- 若您或他人涉及此类情况，应立即停止违法行为，并主动配合相关部门的调查和处理。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。