村经济合作社（通常可理解为村委会或其下属经济实体）投资入股在遵循相关法律法规、履行必要程序，并确保资金来源合法、经营范围合规的前提下，是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与资格确认
《中华人民共和国民法典》：该法明确规定农村集体经济组织依法取得法人资格，这意味着村委会或其下属经济实体，如村经济合作社，具备从事民事活动的权利和能力，包括入股公司。
《公司法》：虽然《公司法》并未直接提及村委会或村经济合作社作为股东，但亦无禁止性规定。它强调股东应遵守法律、行政法规和公司章程，这为村经济合作社入股公司提供了法律基础。
《公司登记管理若干问题的规定》：该规定明确指出，村民委员会（同样适用于村经济合作社）可以作为投资主体设立公司，即成为有限责任公司的股东。
其他相关法律法规：如《农村土地承包法》等，允许在保障村民权益和符合集体资产管理程序的前提下，对集体资产进行合理运营，入股公司是其中一种方式。
二、入股方式与程序
入股方式：村经济合作社可以通过将村集体资产（如土地、资金、设备等）作价入股的方式，参与到相关企业或项目中，成为股东。这种入股方式有助于盘活集体资产，促进村集体经济的发展。
民主决策程序：入股前必须召开村民会议或村民代表会议，讨论并表决入股事宜。确保有足够数量的村民或户代表参加，所作决定需经到会人员过半数通过。这是保障村民知情权、参与权、决策权的关键步骤。
三、资金来源与资产合法性
合法积累：入股资金必须是村集体通过合法途径积累的财产，如土地发包收入、村办企业利润、集体资产出租收入等。
土地入股特别规定：若涉及农村集体土地入股，需依法办理农用地转用审批手续，且不得改变土地用途性质，确保耕地红线不被突破。同时，非货币资产入股需进行资产评估，并办理相关产权转移手续。
四、经营范围与目的审查
合规性：入股公司所从事的经营活动应符合国家法律法规和政策导向，不得从事高风险、违法违规或损害集体利益的业务。
村集体利益：投资项目应有助于推动农村产业发展、增加农民收入、改善农村基础设施等，促进农村经济社会的可持续发展。
五、登记备案与后续管理
股权变更登记：完成入股后，需按照相关规定办理股权变更登记等手续，确保入股行为的法律效力。
内部管理制度：村经济合作社应建立完善的内部管理制度和风险控制机制，对入股后的股权管理、收益分配等进行明确规定，防止村集体资产遭受损失。
持续监督与评估：定期对入股公司进行监督和评估，确保其经营行为符合法律法规和村集体利益。
六、注意事项与风险提示
避免利益冲突：村经济合作社在入股过程中应谨慎处理可能存在的利益冲突问题，确保职责和使命不受商业利益影响。
充分投资评估：入股前应进行全面的调查和评估，包括但不限于公司的财务状况、市场前景、管理团队等，以降低投资风险。
总结：村经济合作社投资入股在遵循相关法律法规、履行必要程序，并确保资金来源合法、经营范围合规的前提下，是合法的且具有实践意义的举措。但在具体操作过程中，必须严格遵守相关法律法规和程序要求，确保合法合规、风险可控，并充分保障村民的集体利益和知情权、参与权、决策权。