免除刑事责任是否会有案底，需根据具体情况来判断。以下从多个角度进行详细分析：
一、不会留下案底的情况
法定不起诉：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的规定，若存在情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的等情形之一，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件、不起诉、终止审理或者宣告无罪。在这些情况下，由于不被认定为犯罪或基于特定法律原因不追究刑事责任，因此不会留下案底。
证据不足不起诉：
- 对于经过二次补充侦查仍认为证据不足的案件，人民检察院应作出不起诉决定。由于现有证据无法证明犯罪嫌疑人构成犯罪，不能认定其有罪，因此也不会留下案底。
特定情形下的免除刑事处罚且未经法院审判定罪：
- 当犯罪嫌疑人虽涉及犯罪行为，但因情节轻微等原因，在侦查阶段或审查起诉阶段即被决定免予追究刑事责任，且未经法院审判定罪时，通常不会留下案底。
二、会留下案底的情况
酌定不起诉但已构成犯罪：
- 尽管检察院因犯罪情节轻微等原因决定不起诉，但本质上已构成犯罪，只是因情节轻微而未被起诉。这种情况下，仍可能留下案底。这种记录不是对任何人开放的，只有司法机关或者律师在办理刑事案件时，报请有权机关审批后，才可以查阅该记录并了解相关内容。
法院判决免除刑事处罚但仍认定犯罪：
- 如果犯罪嫌疑人经过法院审判，被认定构成犯罪，但由于存在一些法定的情节（如犯罪中止、从犯、自首且犯罪较轻等），法院判决免除刑事处罚。此时，由于已被法院认定构成犯罪，所以会留下案底。案底通常指的是犯罪记录，一旦法院作出有罪判决，即使免除刑事处罚，也意味着司法机关认定其实施了犯罪行为，相关犯罪信息会被记录在个人的犯罪档案中。
法律建议
- 对于个人而言：了解免除刑事责任是否会留下案底，有助于个人在面临刑事法律风险时做出更明智的决策。如果担心可能留下案底，应尽早咨询专业律师，了解自身法律状况，并寻求合适的法律帮助。
- 对于司法机关而言：在处理刑事案件时，应严格依法办事，确保每一个决定都符合法律规定。对于免除刑事责任的案件，应明确记录相关情况，以便后续查询和参考。
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