在农村建房时，未婚儿子出过资但没有合法出资证明，这一出资在法律上的效力及认定情况需分点详细说明：

1. 出资证明的重要性：

   • 在法律上，出资证明是确认出资行为及出资份额的关键证据。它可以是书面合同、转账记录、收据、证人证言等多种形式。若缺乏合法有效的出资证明，出资行为的法律效力和出资份额的确认将面临挑战。

2. 无合法出资证明时的法律认定：

   • 出资行为可能被否认：若无合法出资证明，其他家庭成员或第三方可能否认未婚儿子的出资行为，导致其在法律上无法主张相应的权益。
   • 出资份额难以确定：即使出资行为被认可，由于缺乏具体证据，出资份额的确定也将变得困难，可能引发家庭内部的纠纷。
   • 法律救济途径有限：在缺乏出资证明的情况下，未婚儿子可能难以通过法律途径维护自己的权益，如要求返还出资、确认产权份额等。

3. 可能的法律后果与建议：

   • 法律后果：若因无合法出资证明而引发纠纷，未婚儿子可能面临无法证明自己出资、无法主张权益的风险。在极端情况下，甚至可能因无法证明出资而承担不利的法律后果。
   • 建议措施：
     • 补办出资证明：若可能，应尽快补办出资证明，如通过银行转账记录、收据、书面合同等方式证明出资行为。
     • 收集其他证据：若无法直接补办出资证明，可尝试收集其他间接证据，如证人证言、家庭会议记录、照片或视频等，以辅助证明出资行为。
     • 协商与调解：在家庭内部，可尝试通过协商或调解的方式解决纠纷，避免法律诉讼带来的时间和经济成本。
     • 法律咨询与诉讼：若协商无果，可寻求专业律师的法律咨询，并在必要时提起诉讼，通过法律途径维护自己的权益。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 若出资用于共同生活或家庭共同事业：在某些情况下，即使无合法出资证明，若出资被用于家庭共同生活或共同事业，未婚儿子仍可能基于家庭关系或公平原则主张一定的权益。但这需要具体分析家庭关系、出资用途及当地风俗习惯等因素。
   • 若存在口头协议或约定：若家庭成员之间存在口头协议或约定，且该协议或约定不违反法律法规的强制性规定，未婚儿子可尝试依据该口头协议或约定主张权益。但口头协议的证明难度较大，需结合其他证据进行综合判断。

总结来说，未婚儿子在农村建房时出资但无合法出资证明，将面临出资行为被否认、出资份额难以确定及法律救济途径有限等风险。因此，建议尽快补办出资证明或收集其他证据，以维护自己的合法权益。若遇到纠纷，可寻求专业律师的法律咨询，并在必要时提起诉讼。有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详细的法律建议。