解除行政强制措施后，扣留的货物是否会归还，需视具体情况而定。以下从多个角度为你详细分析：
一、应当归还的情况
与案件无关：
- 根据《中华人民共和国行政强制法》第二十五条及《中华人民共和国治安管理处罚法》第八十九条，行政机关在扣押物品后，若经调查确认该物品与案件没有直接关联，应当及时退还给当事人。
- 例子：若因涉嫌销售假冒商品被扣押了一批货物，但经调查发现其中部分货物为合法采购，与假冒商品无关，则这部分货物应当被退还。
不再需要作为证据：
- 随着调查的深入，某些物品可能不再作为证明违法事实的证据，此时行政机关也应当退还这些物品。
- 例子：在调查一起环境污染案件时，扣押了可能含有污染物的样品，但后续通过其他证据已经充分证明了污染事实，且样品已失去进一步检测的价值，则样品应当被退还。
案件调查终结且当事人无违法行为：
- 若案件调查终结，且当事人被认定不存在违法行为，那么扣押的物品就失去了扣押的依据，行政机关应当退还。
- 例子：因涉嫌偷税漏税被扣押了财务账簿，但经税务机关调查后确认当事人并无偷税漏税行为，则财务账簿应当被退还。
二、不予归还的情况
依法应当没收的物品：
- 若扣押的物品属于违法所得或依法应当没收的财物，如生产、销售假药、劣药等违法行为中的涉案物品，则不予退还，而是上缴国库。
- 例子：因销售假冒注册商标的商品被扣押了一批假货，经调查确认后，这批假货应当被没收并上缴国库。
作为后续处罚执行保障：
- 在某些情况下，即使当事人被认定存在违法行为，但若其未履行罚款等义务，行政机关也可能暂不退还扣押的物品，以作为后续处罚执行的保障。不过，这种情况并非绝对，具体需根据案件情况和法律规定来判断。
三、退还程序
若行政机关决定退还扣押的物品，应当遵循以下程序：
- 查明事实：行政机关需详细调查扣押物品与案件的关系，确保退还决定的准确性。
- 作出决定：基于调查结果，行政机关应当作出是否退还扣押物品的决定，并及时通知当事人。
- 执行发还：在退还物品时，行政机关应当清点物品，确保数量、状态与扣押时一致，并制作退还清单由当事人签字确认。
四、特殊情况处理
- 违法所得：一律没收上缴国库，不予退还。
- 不宜长期保存的物品：如易腐烂、变质的物品，行政机关应当按照相关规定及时处理，如拍卖、变卖等，所得款项上缴国库。
- 无人主张权利或无法查清权利人：若扣押的物品满六个月无人主张权利或无法查清权利人，行政机关应当公开拍卖或按照国家有关规定处理，所得款项上缴国库。
总结来说，解除行政强制措施后，扣留的货物是否会归还取决于物品与案件的关系、是否需要作为证据、当事人是否存在违法行为以及物品的性质等多种因素。若你对具体案件有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。