在仲裁程序中能否申请追加发包人为被申请人，需根据具体情况判断，核心在于仲裁协议的效力范围及发包人与案件的关联性，具体分析如下：

1. 若发包人与承包人之间存在有效仲裁协议，且争议事项属于协议约定范围
   根据《仲裁法》第16条、第18条，仲裁协议需明确约定仲裁事项、仲裁机构，且意思表示真实。若发包人与承包人签订的合同中包含有效仲裁条款，且争议事项（如工程质量、工期、价款等）属于该条款覆盖范围，则承包人或实际施工人可依据该协议，在仲裁程序中申请追加发包人为被申请人。此时，仲裁机构需审查仲裁协议的效力及争议事项的关联性，若符合条件，通常会准许追加。

2. 若发包人与承包人之间无仲裁协议，但实际施工人与发包人存在直接权利义务关系
   根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第43条，实际施工人可突破合同相对性，直接起诉发包人要求在欠付工程款范围内承担责任。但仲裁程序中，若实际施工人与发包人之间无仲裁协议，且发包人未参与原仲裁协议的签订，则实际施工人不能直接申请追加发包人为被申请人。此时，实际施工人需通过诉讼程序主张权利，或与发包人另行达成仲裁协议后申请仲裁。

3. 若发包人自愿参与仲裁并提交答辩意见
   即使发包人与申请人之间无仲裁协议，若发包人自愿参与仲裁程序（如提交答辩意见、参加庭审等），且未在首次开庭前提出异议，根据《仲裁法》第20条，可视为发包人接受仲裁管辖。此时，仲裁机构可依职权或依申请追加发包人为被申请人，但需以发包人明确同意为前提。

实务建议：

• 申请追加前，需核查发包人与原被申请人之间的合同关系及仲裁协议效力；
  
• 若缺乏仲裁协议，可尝试与发包人协商签订补充仲裁协议，或通过诉讼程序解决；
  
• 追加申请需在仲裁庭首次开庭前提出，并提交初步证据证明发包人与争议事项的关联性。
  

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