对方骑摩托车闯红灯，而您被认定承担次要责任，这一认定是否合理，需结合具体事故情况及交警部门的调查结果来判断。以下从多个角度为您分析这一情况：
一、责任认定的基本原则
在交通事故中，责任认定主要依据《道路交通事故处理程序规定》及相关法律法规，综合考虑事故双方的过错程度、行为对事故发生的作用以及过错的严重程度等因素。闯红灯是严重的交通违法行为，通常会被认定为承担主要或全部责任。然而，如果您在事故中也存在过错，如未保持安全车速、未注意观察路况等，那么您可能会被认定承担一定的次要责任。
二、您可能被认定承担次要责任的情况
未保持安全车速：如果您在行驶过程中未按照规定的车速行驶，或者车速过快，导致在对方闯红灯时无法及时避让，从而发生事故，那么您可能会被认定承担一定的次要责任。
未注意观察路况：作为驾驶员，您有义务注意观察前方的路况和交通信号。如果您在行驶过程中未注意到对方闯红灯的行为，或者未及时采取避让措施，那么您也可能会被认定承担一定的责任。
其他过错行为：除了上述两种情况外，如果您在事故中还存在其他过错行为，如未按规定使用灯光、未按规定让行等，那么这些过错行为也可能会成为您被认定承担次要责任的原因。
三、对责任认定结果不服的应对措施
如果您对交警部门出具的责任认定结果不服，认为自己在事故中不应承担次要责任，那么您可以在规定期限内向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请。复核申请应当载明复核请求及其理由和主要证据，以便复核机关对责任认定结果进行重新审查。
四、后续赔偿事宜的处理
在责任明确后，双方可以协商赔偿事宜。如果协商不成，您可以通过法律途径解决争议，向人民法院提起民事诉讼，要求责任方赔偿您的医疗费、误工费、护理费、财产损失等。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明自己的损失和对方的过错程度，以便法院能够做出公正的判决。
五、预防类似事故的建议
为了避免类似事故的再次发生，我建议您在行驶过程中严格遵守交通规则，保持安全车速，注意观察路况和交通信号。同时，您也可以考虑购买机动车第三者责任强制保险或商业险，以便在发生事故时能够得到及时的赔偿和保障。
最后，我想强调的是，每个交通事故都有其独特的情况和复杂性。因此，在处理此类问题时，建议您及时咨询专业律师或相关机构，以便获得更具体、更专业的法律建议和帮助。如果您有任何法律问题或需要进一步的咨询，请随时向我提问。