因违法行为补交土地出让金及违法所得的收缴，需依据具体违法情形，通过行政处罚、行政强制执行或司法程序进行收缴。具体分析如下：
补交土地出让金的收缴
- 行政处罚决定：若土地使用权人存在未按照出让合同约定支付土地出让金等违法行为，国土资源主管部门有权依据《中华人民共和国土地管理法》《中华人民共和国城市房地产管理法》等相关法律法规，作出责令限期补交土地出让金的行政处罚决定。
- 行政强制执行：若土地使用权人在法定期限内未履行补交土地出让金的义务，国土资源主管部门可依法申请人民法院强制执行，要求其补交土地出让金及可能产生的滞纳金。滞纳金的具体计算方式，通常依据出让合同约定或地方性法规规定。
- 司法程序：在涉及土地使用权转让、抵押等司法案件中，若法院认定土地使用权人存在未足额支付土地出让金的违法行为，可在判决中直接要求其补交土地出让金，并通过司法执行程序予以收缴。
违法所得的收缴
- 违法所得的认定：违法所得通常指土地使用权人通过违法行为（如擅自改变土地用途、非法转让土地使用权等）所获得的经济利益。其认定需依据具体违法行为及实际获利情况，可能包括转让价款、租金收入、增值收益等。
- 行政处罚决定：国土资源主管部门在查处土地违法行为时，若认定存在违法所得，可依据《中华人民共和国土地管理法实施条例》等相关规定，作出没收违法所得的行政处罚决定。
- 行政强制执行与司法程序：与补交土地出让金类似，若土地使用权人未在法定期限内履行缴纳违法所得的义务，国土资源主管部门可申请人民法院强制执行；在司法案件中，法院也可直接判决没收违法所得，并通过司法执行程序予以收缴。
特殊情形：若土地违法行为同时涉及刑事犯罪（如非法转让、倒卖土地使用权罪），则违法所得的收缴可能通过刑事司法程序进行，即由公安机关在侦查阶段查封、扣押涉案财物，检察院提起公诉时一并追缴，最终由法院判决没收。
建议：若您面临因土地违法行为需补交土地出让金或缴纳违法所得的情形，建议及时咨询专业律师，了解具体违法情形、法律责任及收缴程序，以便依法维护自身权益或履行法定义务。如有进一步疑问，可直接向我提问。