在处理合同逾期未付款的违约金问题时，我们首先要明确的是，违约金的数额或计算方法主要由合同双方约定，并需遵循法律法规的强制性规定和公序良俗。以下是对这一问题的详细解答：
一、合同有明确约定的情况
约定具有法律效力：
- 如果合同双方在签订合同时已经明确约定了逾期付款的违约金数额或计算方法（例如，每逾期一日，按未付款金额的万分之五支付违约金），那么这一约定在不违反法律法规强制性规定的前提下，是具有法律效力的。
违约金的调整：
- 尽管合同有约定，但如果约定的违约金过高或过低，与实际损失相差悬殊，违约方或守约方均有权请求人民法院或仲裁机构予以适当调整。调整时，会综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度、预期利益以及公平原则和诚实信用原则等因素。
二、合同未明确约定或约定不明确的情况
参照法律法规及司法实践：
- 当合同对逾期付款违约金没有约定或约定不明确时，我们可以参照相关法律法规及司法实践来确定违约金数额。根据《民法典》及相关司法解释，逾期付款违约金通常可按未支付金额的一定比例计算，该比例常在每日万分之三到万分之五之间，但具体比例会由合同性质、违约情况等因素决定，并在法律允许范围内协商确定。
损失赔偿的考量：
- 若无具体约定，受损害方还可以主张违约方赔偿因逾期支付造成的损失，包括合同履行后可获得的利益。但这一损失赔偿不得超过违约方订立合同时预见或应当预见的损失范围。在司法实践中，金钱债务逾期履行的损失赔偿常参照银行贷款利率或贷款市场报价利率（LPR）等标准确定。
三、实际操作中的建议
明确约定违约金：
- 在签订合同时，双方应尽可能明确约定逾期付款的违约金数额或计算方法，以减少后续纠纷。
综合考量多种因素：
- 在确定违约金数额时，应综合考虑合同的性质、内容、违约的严重程度以及违约可能造成的损失等多种因素。
寻求法律咨询：
- 如遇复杂或争议较大的情况，建议及时咨询专业的律师或法律机构，以获得准确的法律意见和帮助。
综上所述，合同逾期未付款的违约金数额或计算方法主要由合同双方约定，并需遵循法律法规的强制性规定和公序良俗。在合同有明确约定时，按约定执行；在合同未明确约定或约定不明确时，则参照相关法律法规及司法实践来确定。在实际操作中，应注重合同的约定、法律法规的规定以及实际情况的综合考量，以确保违约金的合理性、合法性及有效性。