公司非法占用耕地与个人非法占用耕地的主要区别体现在行为主体、行为性质、法律后果及处理方式上，以下为你详细分析：
一、行为主体
- 公司非法占用耕地：行为主体是公司、企业或其他经济组织。这些主体通常具有法人资格，能够独立承担民事责任，且其非法占用耕地的行为往往与其经营活动相关。
- 个人非法占用耕地：行为主体是自然人，即个人。个人非法占用耕地可能是出于居住、耕种、建设等个人目的。
二、行为性质
公司非法占用耕地：
- 往往涉及大规模的土地开发、建设或经营活动，对耕地的破坏程度可能更为严重。
- 可能涉及违反土地管理法规、城乡规划法规等多部法律法规，情节复杂。
个人非法占用耕地：
- 通常规模较小，可能是为了满足个人居住、耕种等基本需求。
- 虽然也违反了土地管理法规，但情节相对简单，对耕地的破坏程度可能较轻。
三、法律后果
公司非法占用耕地：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关法律法规，公司非法占用耕地的，可能面临责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状等行政处罚。
- 如果非法占用耕地数量较大或者造成耕地大量毁坏的，还可能构成非法占用农用地罪，依法追究刑事责任。
- 此外，公司还可能因非法占用耕地而面临民事赔偿责任，如赔偿因耕地破坏给农民或集体造成的损失。
个人非法占用耕地：
- 个人非法占用耕地的，同样可能面临责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状等行政处罚。
- 如果非法占用耕地数量较大或者造成耕地大量毁坏的，也可能构成非法占用农用地罪，但相对于公司而言，个人因非法占用耕地而构成犯罪的情况可能较少。
- 个人同样可能因非法占用耕地而面临民事赔偿责任。
四、处理方式
公司非法占用耕地：
- 政府部门在处理公司非法占用耕地时，通常会采取更为严格的监管措施，如加强巡查、加大处罚力度等。
- 对于涉嫌犯罪的公司，公安机关会依法进行立案侦查，并移送检察机关审查起诉。
个人非法占用耕地：
- 政府部门在处理个人非法占用耕地时，可能会更加注重教育引导，鼓励个人自行纠正违法行为。
- 对于情节较轻的个人非法占用耕地行为，政府部门可能会采取警告、罚款等行政处罚措施。
总结与建议：无论是公司还是个人，非法占用耕地都是违法行为，都会受到法律的制裁。因此，建议任何单位和个人都应严格遵守土地管理法规，不得非法占用耕地。如果你或你所在的公司、个人涉及非法占用耕地的问题，或者有任何关于房产（包括农村土地、宅基地）方面的法律疑问，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。