在医疗纠纷中，二次鉴定伤并非一定由法院指定，而是根据具体情况和法律规定来确定。以下是对这一问题的详细分析：

一、二次鉴定的启动主体

1. 当事人申请：在医疗纠纷中，如果当事人对首次鉴定结果有异议，他们有权向法院申请重新鉴定。这是当事人维护自身权益的一种重要途径。根据《医疗事故处理条例》等相关法律法规，当事人对首次医疗事故技术鉴定结论不服的，可以自收到首次鉴定结论之日起15日内向医疗机构所在地卫生行政部门提出再次鉴定的申请。虽然这里提到的是向卫生行政部门申请，但在实际诉讼过程中，当事人通常是通过法院来启动二次鉴定程序的。

2. 法院依职权决定：在某些情况下，法院也可能依职权决定进行二次鉴定。这通常发生在法院认为首次鉴定存在明显问题，如鉴定程序违法、鉴定结论明显依据不足等，或者为了更全面地了解案件事实，确保判决的公正性和准确性时。

二、二次鉴定的程序与要求

1. 鉴定机构的选择：无论是当事人申请还是法院依职权决定，二次鉴定都应当选择具备相应资质的鉴定机构进行。这些鉴定机构通常具有更高的专业水平和更严格的鉴定程序，能够确保鉴定结果的准确性和公正性。

2. 鉴定材料的提交：在进行二次鉴定时，当事人需要提交与首次鉴定相同的鉴定材料，并可能需要补充一些新的材料以支持其主张。这些材料应当真实、完整、合法，并能够充分反映案件事实。

3. 鉴定过程的监督：二次鉴定过程应当受到严格的监督和管理，确保鉴定程序的合法性和鉴定结论的公正性。鉴定机构应当按照规定的程序和方法进行鉴定，并出具详细的鉴定报告。

三、二次鉴定结果的效力

1. 对当事人的影响：二次鉴定结果通常会对当事人的权益产生重要影响。如果二次鉴定结果与首次鉴定结果不同，那么法院在判决时可能会更倾向于采纳二次鉴定结果。因此，当事人在申请二次鉴定时应当充分准备，确保鉴定结果能够支持其主张。

2. 对法院判决的依据：二次鉴定结果也是法院判决的重要依据之一。法院在审理医疗纠纷案件时，会综合考虑双方当事人的证据和鉴定结果，以作出公正、合理的判决。

四、建议与注意事项

1. 及时申请：如果当事人对首次鉴定结果有异议，应当及时向法院申请二次鉴定，以免错过申请期限。

2. 充分准备：在申请二次鉴定时，当事人应当充分准备鉴定材料，并可能需要咨询专业律师以了解鉴定程序和注意事项。

3. 尊重鉴定结果：无论二次鉴定结果如何，当事人都应当尊重鉴定结果，并据此进行后续的法律行动。如果认为鉴定结果存在错误或不当之处，可以通过合法途径进行申诉或复议。

在医疗纠纷中遇到二次鉴定伤的问题时，不必过于担心或焦虑。你可以根据自己的具体情况和法律规定来决定是否申请二次鉴定，并寻求专业律师的帮助以确保自身权益得到充分保障。如果你有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。