针对“员工如有再犯如何处理”这一问题，我们首先需要明确“再犯”的定义及其处理原则，并结合具体情境进行详细分析。
一、再犯的定义
再犯，通常指的是员工在前一次违纪行为受到处分后，又再次发生违纪行为的情况。这里的关键点在于，后一次违纪行为必须发生在前一次处分决定生效之后。
二、再犯的处理原则
根据相关规定，如果员工再犯，应当从重或者加重处分。这是因为再犯表明员工没有从前一次的处分中吸取教训，继续违反规定，因此需要给予更严厉的处罚以儆效尤。
三、具体情境分析
以您提供的案例为例，丁某在第一次违纪行为（违反工作纪律）尚未受到最终处分决定前，又被发现存在另一次违纪行为（违反组织纪律）。在这种情况下，我们并不能直接将其视为再犯，因为前一次的处分决定尚未生效。
如果前一次处分决定已生效：若丁某在第一次违纪行为受到处分决定生效后，又再次发生违纪行为，那么根据再犯的处理原则，应当对其从重或者加重处分。
如果前一次处分决定未生效：如案例中所示，丁某的第一次违纪行为尚未经党组讨论研究，处分决定尚未作出，更谈不上生效。在这期间又发现了其他违纪行为，那么这两种违纪行为应当合并处理。根据相关规定，一人有两种以上应当受到党纪处分的违纪行为，应当合并处理，按其数种违纪行为中应当受到的最高处分加重一档给予处分。
四、建议处理流程
调查核实：首先，需要对员工的违纪行为进行全面、客观的调查核实，确保事实清楚、证据确凿。
沟通讨论：将调查结果与员工所在单位或部门进行沟通讨论，听取其意见和建议。
作出决定：根据调查结果和相关规定，作出最终的处分决定。如果涉及再犯或合并处理的情况，需要严格按照规定执行。
执行处分：将处分决定及时通知员工本人，并确保其执行到位。同时，做好后续的监督和管理工作，防止类似问题再次发生。
综上所述，对于员工再犯的处理，我们需要根据具体情况进行具体分析，严格按照相关规定执行，确保处理的公正性和合理性。