结论前置：当抚养费纠纷案件中起诉主体不适格时，法院确实有可能驳回起诉，但具体处理方式会根据诉讼阶段和主体不适格的具体情况有所不同。以下是对此问题的详细分析：

一、起诉阶段发现主体不适格

1. 原告主体不适格

   • 法院依职权审查：在立案受理阶段，法院会严格审查原告的主体资格。若发现原告与案件无直接利害关系，例如非未成年子女或不能独立生活的成年子女本人起诉要求抚养费，法院将裁定不予受理，因为原告主体不适格。
   • 补充或变更主体：若因程序性或形式性问题导致原告主体看似不适格，如错列法定代理人作为原告，法院可能会给予指导和释明，允许当事人在指定期限内补充或变更主体，以符合起诉条件。

2. 被告主体不适格

   • 法院释明并要求更正：若起诉时被告主体错误，例如将非直接抚养方错误列为被告，法院将向原告释明情况，并要求其在一定期限内更正被告信息，明确正确的被告。

二、诉讼过程中发现主体不适格

1. 驳回起诉：在诉讼过程中，如果经法院审查确认原告主体不适格，且无法通过补充、变更等方式使其符合条件，法院将裁定驳回起诉。例如，在诉讼过程中发现原告并非真正的抚养费权利人，或者法定代理人未经授权擅自以子女名义起诉等。

2. 更换当事人：对于被告主体不适格的情况，如果原告能在合理期限内明确正确的被告并申请更换，法院一般允许更换被告，以使诉讼继续进行。若原告坚持不更换或无法确定正确的被告，法院可能裁定驳回起诉或终结诉讼。

三、重新提起诉讼及准备相关证据

当发现起诉主体不适格时，应当重新以适格主体的名义提起诉讼，并准备好相关证据以支持诉讼请求。这些证据包括但不限于：

• 亲子关系证明：如出生证明、户口本等，以证明原告与被告之间的亲子关系。
• 对方未支付抚养费的证据：如银行转账记录、收据、聊天记录等，以证明被告未履行支付抚养费的义务。
• 开销增大的相关证据：如生活消费增加的相关证据票据，或者住院、上学的大额开销的相关票据，以证明需要增加抚养费的理由（若涉及抚养费变更之诉）。

四、对主体不适格裁定不服的救济途径

1. 上诉：若当事人对法院关于主体不适格作出的不予受理裁定、驳回起诉裁定不服，可在裁定书送达之日起十日内向上一级人民法院提起上诉，提交上诉状并阐述自己认为主体适格的理由和依据。
2. 申请再审：若当事人认为已经生效的关于主体不适格的裁定存在错误，且在符合法定条件的情况下，可向作出该裁定的人民法院或者上一级人民法院申请再审，提供足以推翻原裁定的新证据或能够证明原裁定存在法定错误情形的相关材料。

五、实际操作建议

• 明确适格主体：在提起诉讼前，务必确认原告和被告的主体资格是否适格。对于未成年子女，应由其法定监护人代为提起诉讼；对于被告，应确保是直接抚养方或负有抚养义务的其他主体。
• 准备充分证据：根据诉讼请求准备充分的证据材料，以证明自己的主张。证据应真实、合法、有效，并能够形成完整的证据链。
• 寻求专业帮助：如果对诉讼程序或法律适用存在疑问，建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。

总结来说，抚养费纠纷案件中起诉主体不适格时，法院的处理方式会根据诉讼阶段和主体不适格的具体情况有所不同。当事人应明确适格主体、准备充分证据，并在必要时寻求专业帮助以维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。