电瓶车在保险公司赔偿后，其归属权需根据保险合同的具体约定以及事故责任认定情况来确定，通常有以下两种情况：
若保险合同中明确约定了赔偿后车辆残值的归属：
- 在这种情况下，应直接依据保险合同的约定来确定电瓶车的归属。如果合同中规定赔偿后车辆残值归保险公司所有，那么在保险公司完成赔偿后，电瓶车将归保险公司处理；反之，如果合同中规定车辆残值归被保险人（即电瓶车车主）所有，那么在赔偿后，电瓶车仍归车主所有。
若保险合同中未明确约定赔偿后车辆残值的归属：
- 在这种情况下，通常需要根据事故责任认定以及公平原则来推断车辆残值的归属。如果事故责任完全在对方，且对方保险公司已经对电瓶车进行了全额赔偿（包括车辆残值部分），那么电瓶车在赔偿后一般应归对方或对方保险公司所有（具体取决于赔偿协议的内容）。
- 如果事故责任部分在电瓶车车主，且保险公司仅对部分损失进行了赔偿，或者赔偿中未明确包含车辆残值部分，那么电瓶车在赔偿后可能仍归车主所有，但车主需自行处理车辆残值（如出售、报废等）。不过，在实际操作中，由于电瓶车已经因事故而报废，其残值可能较低，车主可能会选择直接放弃或交由保险公司处理。
额外说明：
- 在处理此类问题时，建议车主首先查阅保险合同中的相关条款，了解赔偿后车辆残值的归属约定。
- 如果合同中未明确约定或约定不明，车主可以与保险公司进行协商，以达成双方都能接受的解决方案。
- 如果协商无果，车主还可以考虑通过法律途径来解决争议，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。不过，在实际操作中，由于此类争议的标的额通常较小，且涉及的法律关系相对简单，因此建议车主优先考虑协商解决。
建议：在处理电瓶车事故赔偿及车辆归属问题时，车主应保持冷静、理性，并尽可能收集相关证据（如事故认定书、保险合同、赔偿协议等），以便在需要时维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。