结论：摩托车被别人套牌且存在违法未处理的情况，理论上不影响您考取小车驾照，但实际操作中可能会因地区管理差异和违章性质面临不同情况。为避免后续麻烦，建议您在报考前处理完所有与套牌相关的违章行为。
一、考取驾照的资格与法规依据
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，考取机动车驾驶证并未明确要求必须先处理完所有的交通违规行为。因此，从法律条文上看，即使存在摩托车被套牌且违章未处理的情况，您仍有权报名参加小车驾照考试。
二、套牌违章未处理对考驾照的具体影响
考试阶段的影响：
- 已报名但未考完所有科目：若套牌摩托车违章属于一般罚款类且未处理，多数地区不会影响您继续参加考试。但部分地区可能要求您先处理违章才能预约后续科目，这取决于当地车管所的具体管理规定。
- 所有科目考完等待发证：若套牌摩托车违章未处理，车管所在审核您的驾驶资格时，可能会发现您存在未处理的交通违法记录，从而拒绝发放驾驶证。
个人信用与驾照管理：
- 套牌违章记录可能记入您的个人交通违法记录，影响您的个人信用。
- 在驾照年检或换证时，未处理的套牌违章可能导致审核不通过，影响您驾照的正常使用。
法律责任：若套牌行为涉及严重违规，如无证驾驶、酒驾等，即便在考取驾照过程中，您也可能面临法律责任追究。因为套牌行为本身就违反了交通法规，且可能掩盖了真实的交通违法行为。
三、特殊情况下的考量
- 已持有其他类型驾驶证：若您已持有其他类型驾驶证（如摩托车驾驶证），且套牌违章行为被记录在您的驾驶档案中，未处理可能影响您驾照的考取或管理。因为车管所在审核您的驾驶资格时，会综合考虑您的整体交通违法情况。
四、法律建议
- 主动查询并处理违章：为避免因套牌违章未处理而影响考取小车驾照，建议您主动查询并处理名下所有的交通违章行为，特别是与套牌相关的违章。这有助于确保您的个人交通记录清白，避免在驾照使用过程中出现不必要的麻烦。
- 保留证据：若您发现摩托车被套牌，应立即向公安机关报案，并保留好相关证据（如报案回执、套牌车辆信息等）。这些证据在后续处理违章和考取驾照时可能起到关键作用。
- 咨询当地车管所：由于不同地区对驾照考试和违章处理的规定可能存在差异，建议您在报考前咨询当地车管所或相关部门，了解具体的报考要求和违章处理流程。
综上所述，虽然摩托车被别人套牌且存在违法未处理的情况在法律上不一定直接阻止您考取小车驾照，但考虑到实际操作中的种种可能的阻碍和后续影响，提前处理违章无疑是更为明智的选择。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。