员工隐瞒结婚又怀孕，公司通常不能以此为由将其辞退。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法律保护基础
孕期、产期、哺乳期的特殊保护：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依据该法第四十条（非过失性辞退）和第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这意味着，除非存在法定可以解除劳动合同的特殊情形，否则公司不能仅因员工怀孕就将其辞退。
个人隐私与知情权：
- 怀孕是女性的基本权利和个人隐私，员工没有义务向单位如实告知其婚姻和怀孕状况。因此，隐瞒怀孕事实并不构成欺诈行为，也不应成为公司辞退员工的理由。
二、特殊情况分析
尽管孕期女职工受到法律保护，但在某些特殊情况下，公司可能仍有权解除劳动合同。然而，这些情况必须严格符合法律规定的条件，并且公司需要提供充分的证据来支持其决定。
严重违反公司规章制度：
- 如果员工存在《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定的情形，如严重违反用人单位的规章制度，且该规章制度经过民主程序制定并已向员工公示，公司可以依法解除劳动合同。但需注意，公司必须证明员工的行为确实构成了“严重违反”规章制度的程度，且该行为与怀孕无关。
岗位特殊性：
- 对于某些特殊岗位，如需要经常出差、高空作业或劳动强度大的岗位，怀孕可能对岗位职责的履行产生一定影响。然而，即使在这种情况下，公司也不能仅凭员工隐瞒怀孕事实就解除劳动合同。公司需要证明该岗位确实不适合孕妇，且在招聘时已明确告知岗位的特殊性，员工故意隐瞒怀孕并成功入职。但这种情况在实践中很难得到支持，因为出于妇女权益保护和反对就业歧视的法律诉求，法院通常会倾向于保护孕期女职工的权益。
三、违法辞退的法律后果
如果公司违法辞退隐瞒怀孕的员工，将面临以下法律后果：
- 继续履行劳动合同：员工可以要求公司继续履行劳动合同，恢复工作岗位，并按照原工资待遇支付工资。
- 支付赔偿金：如果员工不要求继续履行劳动合同或劳动合同已经不能继续履行，公司应当依照法律规定向员工支付赔偿金。赔偿金标准为经济补偿标准的二倍，即按照员工在公司工作的年限，每满一年支付两个月工资的标准向员工支付。
四、建议与总结
对于公司：
- 在处理员工隐瞒怀孕的情况时，公司应以沟通和协商为主，合理安排工作任务和工作时间，确保员工能够在孕期正常工作。
- 公司应加强内部管理，避免对怀孕女员工的歧视，确保员工的合法权益不受侵犯。
- 如果公司确实需要解除与孕期女职工的劳动合同，必须确保符合法律规定的条件，并提供充分的证据来支持其决定。
对于员工：
- 虽然怀孕是个人隐私，但在合适的时机应主动向公司说明情况，以便公司做出合理安排。
- 员工应遵守公司规章制度，认真履行工作职责，避免因个人行为给公司造成损失或影响。
综上所述，员工隐瞒结婚又怀孕，公司通常不能以此为由将其辞退。公司应尊重员工的个人隐私和生育权利，遵守相关法律法规，确保员工的合法权益不受侵犯。如果公司对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。