结论前置：被诬陷偷了箱子里东西但留下了指纹，要自证清白，可以从收集证据、申请指纹鉴定、配合警方调查、寻求法律帮助等多个角度入手。以下为你详细阐述：
一、收集证据
寻找目击证人：
- 回忆案发时是否有其他人在场，尤其是那些可能看到箱子被打开或物品被拿走的人。
- 尽快联系这些目击证人，记录他们的证言，并尽可能让他们出具书面证词或愿意在法庭上作证。
保留相关物品：
- 如果箱子或箱子内的物品有特殊标记、损坏痕迹或其他特征，保留这些物品作为证据。
- 拍摄箱子和物品的照片或视频，以记录其原始状态。
收集其他间接证据：
- 如果有监控录像，尝试获取案发时段的录像资料，以证明你的行踪或行为。
- 收集其他可能证明你清白的证据，如不在场证明、工作记录、通讯记录等。
二、申请指纹鉴定
了解指纹鉴定的原理：
- 指纹鉴定是通过比较现场遗留的指纹与嫌疑人的指纹，以确定是否匹配的一种科学方法。
- 如果指纹鉴定结果显示现场指纹与你的指纹不匹配，这将是一个有力的证据来证明你的清白。
申请指纹鉴定：
- 向警方提出申请，要求进行指纹鉴定。警方通常会根据案件情况决定是否进行鉴定。
- 如果警方拒绝或未及时进行鉴定，你可以考虑委托第三方鉴定机构进行鉴定，但需注意选择有资质的正规机构。
三、配合警方调查
如实陈述事实：
- 在接受警方询问时，如实陈述你的行踪、行为以及与案件相关的情况。
- 不要隐瞒或歪曲事实，以免给自己带来不必要的麻烦。
提供证据材料：
- 将你收集到的证据材料提供给警方，以便他们进行调查和核实。
- 配合警方进行现场勘查、指纹提取等工作。
保持冷静和合作态度：
- 在整个调查过程中，保持冷静和合作的态度，不要与警方发生冲突或对抗。
- 相信警方会依法进行调查，并会给出公正的处理结果。
四、寻求法律帮助
咨询专业律师：
- 如果你觉得自己无法有效应对这种情况，或者担心自己的权益受到侵害，可以寻求专业律师的帮助。
- 作为专注于刑事辩护的律师，我可以为你提供法律咨询和辩护服务，帮助你维护自己的合法权益。
了解法律程序和权利：
- 在律师的帮助下，了解相关的法律程序和你的权利，如申请取保候审、申请复议或申诉等。
- 根据律师的建议，采取合适的法律行动来维护自己的权益。
后续行动建议：在自证清白的过程中，务必保持冷静和理智，不要采取过激或违法的行为。同时，密切关注案件的进展和警方的调查结果，及时与律师沟通并调整策略。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。