合同扫描件本身不能直接作为开发票的依据，但结合其他条件可证明交易真实性时，不影响发票的法律效力。以下从不同角度展开分析：

1. 合同扫描件的法律性质
   根据《民法典》第469条，合同形式包括书面、口头或其他形式，电子合同（含扫描件）与纸质合同具有同等法律效力，但需满足真实性、关联性、合法性要求。若扫描件经技术手段验证未被篡改（如区块链存证），或双方认可其内容，可作为交易存在的初步证据。但若对方否认扫描件真实性，需通过其他证据（如聊天记录、付款记录）佐证。

2. 开发票的法定要求
   根据《发票管理办法》第19条，销售方开具发票需以实际发生交易为前提，而非仅依赖合同。因此：

   • 若扫描件能证明交易真实（如与物流、资金流信息一致），可据此开票；
     
   • 若扫描件无法证明交易（如无对应付款记录），仅凭扫描件开票可能被认定为虚开发票，面临税务处罚（《税收征收管理法》第63条）。

3. 实务中的风险防范

   • 对交易方：建议要求对方提供合同原件或通过公证的电子合同，降低证据瑕疵风险；
     
   • 对开票方：开具发票前需核实交易真实性，保留送货单、验收单等辅助证据，避免因“票货不符”被税务机关调查。

总结：合同扫描件可作为开票的辅助证据，但需结合其他材料证明交易真实性。若您遇到具体纠纷（如对方拒认扫描件效力、税务机关质疑发票真实性），可进一步向我说明细节，我会结合证据链为您分析应对方案。