首先，我们需要明确的是，运输企业被强制执行给挂靠车主造成损失，赔偿的具体方式和责任划分需根据实际情况来确定。以下是我根据法律实务经验，为您详细梳理的几种可能情况及相应的赔偿方式：

1. 明确合同关系：

   • 如果运输企业与挂靠车主之间签订了明确的挂靠合同，并且合同中对于因企业原因导致的损失赔偿有具体约定，那么赔偿应首先按照合同约定进行。
   • 如果合同中没有明确约定或约定不明确，则需要根据相关法律法规以及双方的实际履行情况来综合判断。

2. 分析损失原因：

   • 如果损失是由于运输企业未履行或未完全履行合同义务（如未按时缴纳税费、未提供必要的协助等）导致的，那么企业应承担相应的赔偿责任。
   • 如果损失是由于挂靠车主自身原因（如违章操作、未按规定保养车辆等）或第三方原因（如交通事故、自然灾害等）导致的，那么企业可能不承担直接赔偿责任，但应根据实际情况提供必要的协助或支持。

3. 确定赔偿范围：

   • 赔偿范围通常包括挂靠车主因企业原因导致的直接经济损失，如车辆被扣押期间的停运损失、因企业违约导致的罚款等。
   • 间接损失（如预期利润损失）的赔偿需根据具体情况来判断，并需有充分的证据支持。

4. 协商与诉讼：

   • 在确定赔偿方式和金额后，双方应首先进行友好协商，尝试达成赔偿协议。
   • 如果协商不成，挂靠车主可以向人民法院提起诉讼，要求运输企业承担相应的赔偿责任。

综上所述，运输企业被强制执行给挂靠车主造成损失的赔偿问题，需要根据双方之间的合同关系、损失原因以及赔偿范围来综合判断。如果您在此方面遇到具体问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。